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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002216`

染色体: Chr08 坐标: 20166998-20168022 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002216`
名称	SmilChr08G002216
描述	probable calcium-binding protein CML18
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	20166998 - 20168022 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001749`
GeneID	`131001749`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001749`
原始查询	`LOC131001749`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable calcium-binding protein CML18
产物	probable calcium-binding protein CML18
Arabidopsis	`AT1G66400` (CML23) calmodulin like 23 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842958] identity=54.2; qcov=0.994; evalue=4.48e-51; confidence=high
Rice	`Os05g0223000` (OsCML18) - identity=57.2; qcov=0.942; evalue=1.94e-53; confidence=high
GO	GO:0005509 (calcium ion binding)
KEGG	smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00036 (EF-hand_1); PF13202 (EF-hand_5); PF13405 (EF-hand_6); PF13499 (EF-hand_7); PF13833 (EF-hand_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001749

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057784300.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057784300.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057784300.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784300.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784300.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:20167316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:20167398`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B59,C50,C71
`Chr8:20167437`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B8
`Chr8:20167438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B59,C50,C71
`Chr8:20167480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,B54
`Chr8:20167488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:20167653`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B117

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784300.1

154 aa

154

EF-hand_8

EF-hand_7

EF-hand_1

EF-hand_6

EF-hand_5

EF-hand_8

EF-hand_1

EF-hand_5

EF-hand_7

EF-hand_1

EF-hand_6

EF-hand_5

EF-hand_8

EF-hand_1

EF-hand_5

PF13833 EF-hand_8 13-36 aa PF13499 EF-hand_7 13-76 aa PF00036 EF-hand_1 15-41 aa PF13405 EF-hand_6 16-41 aa PF13202 EF-hand_5 17-38 aa PF13833 EF-hand_8 49-76 aa PF00036 EF-hand_1 53-77 aa PF13202 EF-hand_5 58-77 aa PF13499 EF-hand_7 88-151 aa PF00036 EF-hand_1 89-117 aa PF13405 EF-hand_6 89-118 aa PF13202 EF-hand_5 90-113 aa PF13833 EF-hand_8 102-152 aa PF00036 EF-hand_1 125-152 aa PF13202 EF-hand_5 132-150 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784300.1`	Pfam	`PF13833`	EF-hand_8	Domain	13	36	6.1e-21	74.6	EF-hand domain pair
`XP_057784300.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	13	76	7.4e-35	119.8	EF-hand domain pair
`XP_057784300.1`	Pfam	`PF00036`	EF-hand_1	Domain	15	41	3.2e-37	124.0	EF hand domain
`XP_057784300.1`	Pfam	`PF13405`	EF-hand_6	Domain	16	41	4e-32	107.5	EF-hand domain
`XP_057784300.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	17	38	3.1e-26	90.3	EF hand
`XP_057784300.1`	Pfam	`PF13833`	EF-hand_8	Domain	49	76	6.1e-21	74.6	EF-hand domain pair
`XP_057784300.1`	Pfam	`PF00036`	EF-hand_1	Domain	53	77	3.2e-37	124.0	EF hand domain
`XP_057784300.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	58	77	3.1e-26	90.3	EF hand
`XP_057784300.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	88	151	7.4e-35	119.8	EF-hand domain pair
`XP_057784300.1`	Pfam	`PF00036`	EF-hand_1	Domain	89	117	3.2e-37	124.0	EF hand domain
`XP_057784300.1`	Pfam	`PF13405`	EF-hand_6	Domain	89	118	4e-32	107.5	EF-hand domain
`XP_057784300.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	90	113	3.1e-26	90.3	EF hand
`XP_057784300.1`	Pfam	`PF13833`	EF-hand_8	Domain	102	152	6.1e-21	74.6	EF-hand domain pair
`XP_057784300.1`	Pfam	`PF00036`	EF-hand_1	Domain	125	152	3.2e-37	124.0	EF hand domain
`XP_057784300.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	132	150	3.1e-26	90.3	EF hand

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928317.1
TTTGTTGCTGTAGATTTTGTGCAATAAATTTAATTAAATATATTCGCGTACAACTTACCACTGCTGTATTTCATAATTAAAAAAGGTAAATAAAGAAATTCCTTCCCTAAACTAAATCTTTACTCTACGCGCACATTAAAACGCGTTTCCATCCCTATATAAACGTCGCCACAACTCTTCGATCGAAAAAAAAAAAACCATATTTCTCTCTTATTCTCTTTCAGTTTGATTATTTTTTCTCCCAAATGGCGAAAAATAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001749
ATGGCGAAAAATAACGCAGCAATCACGCTAACCCTAGAAGAAGAGGTCGAGAAAGTCTTCAGCAAGTTCGACACCAATGGCGACGGCAAGATTTCGCTGGCCGAACTCGGCGACATACTCAACGGTCTCGAATCCGGATCCGCCACTTCCGCCGACGAGGTGAAGCGCATAATGTCGGAGCTCGACACCGACGGCGACGGATTCATCGACTTGAACGAGTTCAAGGCCTTCCACTGCGGCGGCGGCGGTGGCGACAGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784300.1
MAKNNAAITLTLEEEVEKVFSKFDTNGDGKISLAELGDILNGLESGSATSADEVKRIMSELDTDGDGFIDLNEFKAFHCGGGGGDSNKELKEAFALYDKDKNGKISANELHSVLRSLGEKCSLKDCRKMISSVDVDGDGCVNFEEFKKMMTRSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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