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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002222`

染色体: Chr08 坐标: 20226402-20227190 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002222`
名称	SmilChr08G002222
描述	kirola-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	20226402 - 20227190 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001754`
GeneID	`131001754`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001754`
原始查询	`LOC131001754`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	kirola-like
产物	kirola-like
Arabidopsis	`AT5G28000` (AT5G28000) Polyketide cyclase/dehydrase and lipid transport superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832870] identity=35.2; qcov=0.755; evalue=1.27e-21; confidence=medium
Rice	`Os04g0465600` - identity=31.1; qcov=0.875; evalue=6.6e-19; confidence=low
GO	GO:0006952 (defense response)
KEGG	-
Pfam	PF00407 (Bet_v_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001754

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057784304.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057784304.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784304.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784304.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784304.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:20226497`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	16	A2,A20,A23,A25,B101,B113,B114,B122,B70,B91,B98,C37,C50,C63,C7,C70
`Chr8:20226900`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784304.1

184 aa

184

Bet_v_1

PF00407 Bet_v_1 41-182 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784304.1`	Pfam	`PF00407`	Bet_v_1	Domain	41	182	5.7e-27	95.2	Pathogenesis-related protein Bet v 1 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928321.1
AAGGTTAGATGAATGATACAAACAATAACAATTAAATATTGTTCCAACAACACTATAAATGCAGACGATTATATGAATTCTTACAAGTACCAAGTAACTAAAATTGATCGAATACCAGAAATGGCAAACAAGGTAGAAACCCTAGTTGCTAGCTCTCCAATCACATGCCCAGCTGATAAATTCTACAATTTCTTCAAGTTCACCATGAACGACATTGTCAAAATATTTCCGGCCGCCTTCACCGGTGTTGAGATCATTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001754
ATGATACAAACAATAACAATTAAATATTGTTCCAACAACACTATAAATGCAGACGATTATATGAATTCTTACAAGTACCAAGTAACTAAAATTGATCGAATACCAGAAATGGCAAACAAGGTAGAAACCCTAGTTGCTAGCTCTCCAATCACATGCCCAGCTGATAAATTCTACAATTTCTTCAAGTTCACCATGAACGACATTGTCAAAATATTTCCGGCCGCCTTCACCGGTGTTGAGATCATTGAAGGAGAGGAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784304.1
MIQTITIKYCSNNTINADDYMNSYKYQVTKIDRIPEMANKVETLVASSPITCPADKFYNFFKFTMNDIVKIFPAAFTGVEIIEGEEGVAGSVKLWHYILGGIPLTAKVLTEAIDDGAKTIKFAVLEGDLLLLYKSFKATLSVSEGSVKWTFEYEKTTILSPPPELYVPLAVTLCTLVDAFLLIN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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