当前解析结果
SmilChr08G002270| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002270 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002270 |
| 描述 | guanine nucleotide-binding protein-like NSN1 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 20974132 - 20976692 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131001794 |
|---|---|
| GeneID | 131001794 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001794 |
| 原始查询 | LOC131001794 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | guanine nucleotide-binding protein-like NSN1 |
| 产物 | guanine nucleotide-binding protein-like NSN1 |
| Arabidopsis | AT3G07050 (NSN1)GTP-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819890] identity=55.1; qcov=0.937; evalue=3.15e-30; confidence=medium |
| Rice | Os01g0375000 (Os_F0781)- identity=48.2; qcov=0.905; evalue=1.02e-24; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001794 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057784370.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057784370.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057784370.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057784370.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057784370.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:20975305 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B32 |
Chr8:20975307 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B32 |
Chr8:20975628 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B52 |
Chr8:20975628 |
C |
CA |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | B52 |
Chr8:20975711 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr8:20975736 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C85 |
Chr8:20975779 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B64,C52,C64,C66 |
Chr8:20975786 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C44 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。