Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002272`

染色体: Chr08 坐标: 20993201-21004115 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002272`
名称	SmilChr08G002272
描述	uncharacterized SmilChr08G002272
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	20993201 - 21004115 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001796`
GeneID	`131001796`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001796`
原始查询	`LOC131001796`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001796

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057784372.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057784372.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784372.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784372.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784372.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:20996780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B42,B44,B51,C39,C54
`Chr8:20996792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,C42
`Chr8:20996815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,C48
`Chr8:20996889`	`TC`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A16,B19,C29
`Chr8:20997038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr8:20997041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr8:20997067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:20997068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr8:20997102`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:20997107`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	61	A13,A16,A3,A6,A8,A9,B10,B102,B106,B107,B109,B110,B113,B131,B134,B136,B138,B18,B2,B21,B3,B30,B33,B38,B39,B41,B49,B50,B51,B53,B56,B65,B7,B70,B78,B82,B84,B87,B96,B98,C14,C17,C20,C23,C30,C35,C39,C41,C5,C53,C55,C56,C61,C63,C66,C67,C70,C74,C79,C9,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009094035.1
TCTTAATGTTACGTTCTTTCTTCATTTTTTTCCTCTCTTTTCCTCTAGATCTTCGGTTCTCTCTCTTTCCTTTTATTCAAACGCAACTCTCTCTCTCTCTCTGTATATGTATTACTTTTTTCATCTCAATTATTTTTCCGACGACCGCATGGATGATTTTCTTTGGTAAAGGCGATATTCATTTTTTCACGTGTTTATTTTGCCTATGTCATCTTCTCTGTAATTATTTCTCCCGTCATCGTCTCTATTTAAATCTGGAG...

XM_057928389.1
TCTTAATGTTACGTTCTTTCTTCATTTTTTTCCTCTCTTTTCCTCTAGATCTTCGGTTCTCTCTCTTTCCTTTTATTCAAACGCAACTCTCTCTCTCTCTCTGTATATGTATTACTTTTTTCATCTCAATTATTTTTCCGACGACCGCATGGATGATTTTCTTTGGTAAAGGCGATATTCATTTTTTCACGTGTTTATTTTGCCTATGTCATCTTCTCTGTAATTATTTCTCCCGTCATCGTCTCTATTTAAATCTGGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001796
ATGCTCTGGCAGATCTGCTCTGAAAGCTTTGCTCTGGCAACTCTGGTTAGCTCTGGCTCTGTCAACTCTGCTCTGGTTAGCTCTGGCTCTGGCAGCTCTGCTCTGGCTTTGTCAGCTCTGCTCTGGCATCTCTGCTCTGGCAACTTGGCTCTGGCCCTCTGCTCTGGAAGCTCTGCTCTGGTTAGCTCTGGCTCTGACAGCTCTGCCCTGGCTAGCTCTGGCTCTGGCAGCTCTGCTCTGGAAGCTCTGCTCTGGCATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784372.1
MLWQICSESFALATLVSSGSVNSALVSSGSGSSALALSALLWHLCSGNLALALCSGSSALVSSGSDSSALASSGSGSSALEALLWHLCSGNLALALCSGSSALVSSGSGRSALEALLWQLCSG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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