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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002288`

染色体: Chr08 坐标: 21333478-21337552 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002288`
名称	SmilChr08G002288
描述	branched-chain amino acid aminotransferase 2, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	21333478 - 21337552 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001814`
GeneID	`131001814`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001814`
原始查询	`LOC131001814`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	branched-chain amino acid aminotransferase 2, chloroplastic-like
产物	branched-chain amino acid aminotransferase 2%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G65780` (LINC4) branched-chain amino acid aminotransferase 5 / branched-chain amino acid transaminase 5 (BCAT5);little nuclei4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836706] identity=67.8; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0106400` - identity=70.2; qcov=0.953; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004084 (branched-chain-amino-acid:2-oxoglutarate transaminase activity); GO:0009081 (branched-chain amino acid metabolic process); GO:0009507 (chloroplast)
KEGG	smil00270 (Cysteine and methionine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00280 (Valine, leucine and isoleucine degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00290 (Valine, leucine and isoleucine biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00770 (Pantothenate and CoA biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00966 (Glucosinolate biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01210 (2-Oxocarboxylic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01063 (Aminotran_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001814

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057784392.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057784392.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784392.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784392.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784392.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:21337317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr8:21337329`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B89,C25,C74
`Chr8:21337338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B107,C8
`Chr8:21337369`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B107,C65,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784392.1

422 aa

211

422

Aminotran_4

PF01063 Aminotran_4 140-378 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784392.1`	Pfam	`PF01063`	Aminotran_4	Domain	140	378	2.9e-37	129.5	Amino-transferase class IV

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928409.1
GTACATCATAAAATTACTAAATTAGTATTGGTAGTGAAGACTGAAGAGTTTGGAGCATAGTGTTATATGCATTTGGTTTTTCGGAGAAATCAGTCAAAGCCGAAAACTTGAGATTTGAGAGAGAACAATGGAGAGCGGCGCAGTTTTTGCTGGCCTACACCCCAATCCCACCCCCCACCACCTCCTTCTCGGCCCTGCCCGCAGTGCTATCAAGCTCCTCCCTCCTCTCACCGACAAGAAATCTATCTCTACTCACCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001814
ATGGAGAGCGGCGCAGTTTTTGCTGGCCTACACCCCAATCCCACCCCCCACCACCTCCTTCTCGGCCCTGCCCGCAGTGCTATCAAGCTCCTCCCTCCTCTCACCGACAAGAAATCTATCTCTACTCACCTTCTTCCTCTCCCGACAGCCGCCGCATTCTCTAAGCAATCGCGTTTCGTTCCTTTCAGTAACCACAATGGTAACACTGGCAATTCGCTTCGAGTGGCGTCGCCCGCCAGCGATGTTGCATTAGAATCAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784392.1
MESGAVFAGLHPNPTPHHLLLGPARSAIKLLPPLTDKKSISTHLLPLPTAAAFSKQSRFVPFSNHNGNTGNSLRVASPASDVALESADIDWDNLGFGFMPTDFMYMMKCSQGETFSKGELQRFGNLELSPSAGILNYGQGLFEGLKAYRKHDGNILLFRPEENATRLREGAVRMCMPAPTVDQFVEAVKATVLANERWIPPPGKGSLYIRPLLMGSGAVLGLAPAPEYTFLIYVSPVGNYFKEGLAPINLIVETEMHRAT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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