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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002322`

染色体: Chr08 坐标: 21877303-21881620 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002322`
名称	SmilChr08G002322
描述	pentatricopeptide repeat-containing protein At5g67570, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	21877303 - 21881620 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001845`
GeneID	`131001845`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001845`
原始查询	`LOC131001845`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pentatricopeptide repeat-containing protein At5g67570, chloroplastic
产物	pentatricopeptide repeat-containing protein At5g67570%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G67570` (DG1) Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836893] identity=52.4; qcov=0.868; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0674700` - identity=39.1; qcov=0.656; evalue=1.04e-133; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0009507 (chloroplast); GO:0009658 (chloroplast organization)
KEGG	-
Pfam	PF01535 (PPR); PF13812 (PPR_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001845

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057784449.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057784449.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784449.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784449.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784449.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:21877624`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:21877958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr8:21878015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,B65,C8,C83
`Chr8:21878090`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:21878129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr8:21878247`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B49,C25
`Chr8:21878423`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B122
`Chr8:21878423`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B122
`Chr8:21878454`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B30,C59,C81,D10
`Chr8:21878509`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr8:21878509`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr8:21878556`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B78,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784449.1

849 aa

424

849

PPR

PPR_3

PPR

PF01535 PPR 248-274 aa PF13812 PPR_3 326-375 aa PF13812 PPR_3 353-396 aa PF01535 PPR 368-396 aa PF01535 PPR 403-432 aa PF01535 PPR 510-535 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784449.1`	Pfam	`PF01535`	PPR	Repeat	248	274	1.3e-22	79.1	PPR repeat
`XP_057784449.1`	Pfam	`PF13812`	PPR_3	Repeat	326	375	1.9e-15	57.4	Pentatricopeptide repeat domain
`XP_057784449.1`	Pfam	`PF13812`	PPR_3	Repeat	353	396	1.9e-15	57.4	Pentatricopeptide repeat domain
`XP_057784449.1`	Pfam	`PF01535`	PPR	Repeat	368	396	1.3e-22	79.1	PPR repeat
`XP_057784449.1`	Pfam	`PF01535`	PPR	Repeat	403	432	1.3e-22	79.1	PPR repeat
`XP_057784449.1`	Pfam	`PF01535`	PPR	Repeat	510	535	1.3e-22	79.1	PPR repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928466.1
GTTGTTAGAATCGAACTGACTCGCAACTTCCATGGAAGCTTCAACAGCTCCACTAAGCCTCCCCAAACCCCCACCGCCTCAACCAGACCTCCAAAAGATCAGCCGCAAGCTCCTCAAACACGGCGTTCACCCCACCCCCAAAATCCTCCACAACCTCCGCAAAAAGGAACTCCAGAAAATCAACCGCCGCGACGCCAAACAAGCCTCCAAGCTCCCGCCGCCCCTCACCGACCTCCAAAACCAAACCATTTTGGAAGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001845
ATGGAAGCTTCAACAGCTCCACTAAGCCTCCCCAAACCCCCACCGCCTCAACCAGACCTCCAAAAGATCAGCCGCAAGCTCCTCAAACACGGCGTTCACCCCACCCCCAAAATCCTCCACAACCTCCGCAAAAAGGAACTCCAGAAAATCAACCGCCGCGACGCCAAACAAGCCTCCAAGCTCCCGCCGCCCCTCACCGACCTCCAAAACCAAACCATTTTGGAAGAATCCCATTTCCAAACGATCAAGTCCGAGTACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784449.1
MEASTAPLSLPKPPPPQPDLQKISRKLLKHGVHPTPKILHNLRKKELQKINRRDAKQASKLPPPLTDLQNQTILEESHFQTIKSEYKKFTRNEQTAKLVGRPWERLDRLRLRELAGEGAEHDGAHLNPEHLRELSDIIECERDRFSWLLDDDVEVEQGLLQERNWAPRKRTEAEAIKLLIDRLSATELSVKDWKFTRTMRHSGLQYTEKQMLKIVEGLGHKGQWRHACSVVEWLYSSKEHRHFKSRFVYTKLLTVLGRAR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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