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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002343`

染色体: Chr08 坐标: 22122725-22127167 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002343`
名称	SmilChr08G002343
描述	phospholipase A(1) LCAT3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	22122725 - 22127167 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001869`
GeneID	`131001869`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001869`
原始查询	`LOC131001869`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phospholipase A(1) LCAT3
产物	phospholipase A(1) LCAT3
Arabidopsis	`AT3G03310` (LCAT3) lecithin:cholesterol acyltransferase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821286] identity=73.1; qcov=0.941; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0615100` - identity=52; qcov=0.9; evalue=6.69e-134; confidence=high
GO	GO:0006629 (lipid metabolic process); GO:0008374 (GO:0008374)
KEGG	smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00592 (alpha-Linolenic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02450 (LCAT); PF07819 (PGAP1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001869

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057784482.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057784481.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057784482.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057784481.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784481.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:22124228`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr8:22124487`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B29,B60,B71
`Chr8:22124499`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B13,B60,B71
`Chr8:22124502`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B13,B60,B71
`Chr8:22124514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B13,B60,B71
`Chr8:22124521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B13,B60,B71
`Chr8:22124571`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B126,B91,B93
`Chr8:22125592`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B39,C10,C82,C85
`Chr8:22125593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B102,B39,C10,C82,C85
`Chr8:22125593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B39,C10,C82,C85
`Chr8:22126114`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:22126140`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C31,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784481.1

447 aa

224

447

LCAT

PGAP1

PF02450 LCAT 65-391 aa PF07819 PGAP1 152-218 aa

XP_057784482.1

410 aa

205

410

LCAT

PGAP1

PF02450 LCAT 65-399 aa PF07819 PGAP1 152-218 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784481.1`	Pfam	`PF02450`	LCAT	Family	65	391	2.5e-25	90.3	Lecithin:cholesterol acyltransferase
`XP_057784481.1`	Pfam	`PF07819`	PGAP1	Domain	152	218	8.8e-07	29.6	PGAP1-like alpha/beta domain
`XP_057784482.1`	Pfam	`PF02450`	LCAT	Family	65	399	5.2e-26	92.5	Lecithin:cholesterol acyltransferase
`XP_057784482.1`	Pfam	`PF07819`	PGAP1	Domain	152	218	7.5e-07	29.8	PGAP1-like alpha/beta domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928498.1
GAACATAGTGGAATATGCTTCTTCATGTGGTGGCCGCTGGCTGCTGCAACTTCTCCATCGTCCAACACCAATTACATTAACTACTTCCAACTGCAAAAAACCCGAAACCGGATAGTGAATTGGGTCATAATCCGATCTAACCGACAATGCTGCGGGACTACTGCTGCTGCTGCAAGTCCAGTATCACCGACACCAACGACGTCGTCTCCGACCGCGATCCGGTTGTCCTGGTCTCGGGTATAGCCGGGTCAATCCTCAAC...

XM_057928499.1
GAACATAGTGGAATATGCTTCTTCATGTGGTGGCCGCTGGCTGCTGCAACTTCTCCATCGTCCAACACCAATTACATTAACTACTTCCAACTGCAAAAAACCCGAAACCGGATAGTGAATTGGGTCATAATCCGATCTAACCGACAATGCTGCGGGACTACTGCTGCTGCTGCAAGTCCAGTATCACCGACACCAACGACGTCGTCTCCGACCGCGATCCGGTTGTCCTGGTCTCGGGTATAGCCGGGTCAATCCTCAAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131001869
ATGCTGCGGGACTACTGCTGCTGCTGCAAGTCCAGTATCACCGACACCAACGACGTCGTCTCCGACCGCGATCCGGTTGTCCTGGTCTCGGGTATAGCCGGGTCAATCCTCAACTCCAAGAAGAAGAAATCCGGGTTCGAGACCCGGGTTTGGGTCCGGCTTTTGCTGGCCAATTTGGAGTTCAAGAAGAAGCTCTGGTCCATGTACAATCCTGAAACAGGGTATACTGAGACATTGGATGATAGTACTGAGATAGTTGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057784481.1
MLRDYCCCCKSSITDTNDVVSDRDPVVLVSGIAGSILNSKKKKSGFETRVWVRLLLANLEFKKKLWSMYNPETGYTETLDDSTEIVVPQDDYGLYAIDILDPSLFVKLLHLSDLYHFHDMIDMLVGCGYKKGTTLFGYGYDFRQSNRISQLMDGLKEKLEAAYKASGGRKVDIISHSMGGLLVSCFISLHNDIFAKYVNKWITIATPFQGAPGCINDSLLTGLQFVEGFESFFFVSRWSMHQLLVECPSIYEMLPNPYFN...

XP_057784482.1
MLRDYCCCCKSSITDTNDVVSDRDPVVLVSGIAGSILNSKKKKSGFETRVWVRLLLANLEFKKKLWSMYNPETGYTETLDDSTEIVVPQDDYGLYAIDILDPSLFVKLLHLSDLYHFHDMIDMLVGCGYKKGTTLFGYGYDFRQSNRISQLMDGLKEKLEAAYKASGGRKVDIISHSMGGLLVSCFISLHNDIFAKYVNKWITIATPFQGAPGCINDSLLTGLQFVEGFESFFFVSRWSMHQLLVECPSIYEMLPNPYFN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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