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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002351`

染色体: Chr08 坐标: 22238147-22241082 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002351`
名称	SmilChr08G002351
描述	protein HEADING DATE 3A-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	22238147 - 22241082 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001877`
GeneID	`131001877`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001877`
原始查询	`LOC131001877`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein HEADING DATE 3A-like
产物	protein HEADING DATE 3A-like
Arabidopsis	`AT1G65480` (FT) PEBP (phosphatidylethanolamine-binding protein) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842859] identity=78.1; qcov=0.96; evalue=2.46e-100; confidence=high
Rice	`Os06g0157700` (Hd3a) - identity=80.1; qcov=0.972; evalue=1.6e-106; confidence=high
GO	-
KEGG	smil04712 (Circadian rhythm - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01161 (PBP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001877

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057784492.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057784492.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057784492.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057784492.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057784492.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:22240743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B40,C28,C58
`Chr8:22240780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B40,C28,C58
`Chr8:22240781`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B40,C28,C58
`Chr8:22240788`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	4	A2,B40,C28,C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784492.1

176 aa

176

PBP

PF01161 PBP 52-146 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784492.1`	Pfam	`PF01161`	PBP	Domain	52	146	3.1e-15	57.5	Phosphatidylethanolamine-binding protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928509.1
AAGAAAGGTCTATAGTGCATGCAAAGAAAAAGAAAATTAGAAAAAGAAAAGGGAAAAAATGCCGAGAGATAGAGACCCTTTGGTTGTAGGTAGGGTGATAGGCGATGTGTTGGATCCTTTCACAAGATCCATTGGTTTGAGAGTGATTTATGGCAACAGAGAAGTTGCAAATGGCTGCGAATTTAGGCCGTCTCAAATCGTGAATCAGCCTAGGGTTGAAGTTGGAGGGGATGATCTTCGCACCTTCTTCACTCTGGTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001877
ATGCCGAGAGATAGAGACCCTTTGGTTGTAGGTAGGGTGATAGGCGATGTGTTGGATCCTTTCACAAGATCCATTGGTTTGAGAGTGATTTATGGCAACAGAGAAGTTGCAAATGGCTGCGAATTTAGGCCGTCTCAAATCGTGAATCAGCCTAGGGTTGAAGTTGGAGGGGATGATCTTCGCACCTTCTTCACTCTGGTGATGGTGGACCCTGATGCTCCCAGCCCCAGTGATCCCAACCTTAGGGAGTACTTGCACTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784492.1
MPRDRDPLVVGRVIGDVLDPFTRSIGLRVIYGNREVANGCEFRPSQIVNQPRVEVGGDDLRTFFTLVMVDPDAPSPSDPNLREYLHWLVTDIPATTGATFGQEIVRYESPRPSMGIHRFVFVLFRQLGRQTVYAPGWRQNFNTRDFAELYNLGSPVATVYYNCQRESGTGGRRRGS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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