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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002342`

染色体: Chr08 坐标: 22115259-22117284 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002342`
名称	SmilChr08G002342
描述	60S ribosomal protein L38
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	22115259 - 22117284 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001878`
GeneID	`131001878`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001878`
原始查询	`LOC131001878`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L38
产物	60S ribosomal protein L38
Arabidopsis	`AT2G43460` (AT2G43460) Ribosomal L38e protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818947] identity=94.2; qcov=1; evalue=3.7e-43; confidence=medium
Rice	`Os07g0546700` (OJ1612_A04.113) - identity=87; qcov=1; evalue=6.91e-41; confidence=medium
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022618 (protein-RNA complex assembly); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01781 (Ribosomal_L38e)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001878

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057784493.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057784493.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784493.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784493.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784493.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:22116663`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	126	A1,A10,A13,A14,A18,A19,A2,A21,A22,A23,A25,A4,A7,A8,A9,B100,B101,B102,B103,B105,B108,B109,B110,B111,B113,B114,B115,B118,B119,B12,B122,B125,B126,B131,B132,B14,B16,B17,B20,B21,B23,B24,B25,B28,B3,B31,B32,B35,B36,B41,B42,B43,B50,B52,B53,B54,B55,B56,B58,B59,B6,B62,B63,B69,B70,B71,B72,B74,B79,B8,B81,B82,B83,B84,B86,B87,B89,B90,B92,B93,B94,B95,B97,C10,C11,C13,C18,C19,C2,C23,C24,C27,C28,C29,C33,C36,C39,C44,C45,C47,C48,C49,C5,C54,C55,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C67,C69,C70,C71,C72,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C87,D3,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784493.1

69 aa

Ribosomal_L38e

PF01781 Ribosomal_L38e 1-66 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784493.1`	Pfam	`PF01781`	Ribosomal_L38e	Domain	1	66	2.3e-36	124.3	Ribosomal L38e protein family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928510.1
CATAACGGGCCAATTTTGAGAGGCCCATTTTGTTTTCAAATGAGCTAACCGAATCCATATTCGGGCTGACTAGTTATAAGAAAATTCAAACCCCTGACCACAAGCGATCTAGGGTTTTTCAGTTTCGCTGCCACTGCAGTCTGCACCTTCAACTGAAGTTCTCCCAGAAAACATGCCTAAGCAAATCCATGAGATCAAGGACTTCCTTCTCACTGCTCGAAGGAAGGACGCACGGTCTGTGAAAATTAAGAGGAGCAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001878
ATGCCTAAGCAAATCCATGAGATCAAGGACTTCCTTCTCACTGCTCGAAGGAAGGACGCACGGTCTGTGAAAATTAAGAGGAGCAAGGATGTCGTGAAGTTCAAGGTTCGGTGCTCCAAGTATCTTTACACACTCTGTGTGTTTGACTCTGAGAAGGCCGAGAAGCTGAAGCAATCCCTCCCACCAGGTTTGAGCGTGCAGGACCTGTAG

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784493.1
MPKQIHEIKDFLLTARRKDARSVKIKRSKDVVKFKVRCSKYLYTLCVFDSEKAEKLKQSLPPGLSVQDL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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