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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002388`

染色体: Chr08 坐标: 22639967-22644267 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002388`
名称	SmilChr08G002388
描述	uncharacterized SmilChr08G002388
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	22639967 - 22644267 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001906`
GeneID	`131001906`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001906`
原始查询	`LOC131001906`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	D-aminoacid aminotransferase-like PLP-dependent enzymes superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824662]; symbol=AT3G54970; hit=AT3G54970; species=arabidopsis; confidence=high
产物	D-aminoacid aminotransferase-like PLP-dependent enzymes superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824662]; symbol=AT3G54970; hit=AT3G54970; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G54970` (AT3G54970) D-aminoacid aminotransferase-like PLP-dependent enzymes superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824662] identity=50.4; qcov=0.916; evalue=2.61e-73; confidence=high
Rice	`Os02g0252600` - identity=41.7; qcov=0.768; evalue=1.14e-28; confidence=medium
GO	GO:0003824 (catalytic activity)
KEGG	-
Pfam	PF01063 (Aminotran_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001906

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057784524.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057784525.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057784524.1`
4	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057784525.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784526.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:22640361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr8:22640591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:22641209`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr8:22642000`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,C59
`Chr8:22642700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C2
`Chr8:22642735`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B19
`Chr8:22642735`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr8:22642745`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784524.1

367 aa

184

367

Aminotran_4

PF01063 Aminotran_4 171-311 aa

XP_057784525.1

356 aa

178

356

Aminotran_4

PF01063 Aminotran_4 171-311 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784524.1`	Pfam	`PF01063`	Aminotran_4	Domain	171	311	4e-15	57.0	Amino-transferase class IV
`XP_057784525.1`	Pfam	`PF01063`	Aminotran_4	Domain	171	311	3.6e-15	57.2	Amino-transferase class IV

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

9 records

下载 cDNA FASTA

XR_009094066.1
TCCTAAATTATTACAAACCTTTTTACGATTTTCATCTTCGTAAACACGCTTACTCTTCTGATTCTCTCCTTCTCTCTGCGCTTCCTCTCACCAATTCCCCAACTCTCCATAACCCGTCCCCTCTGCCGGCGGCCACCCTACCTGGCTCATCCGCGACTTGGCGTCGCCGCTCGCCTTCCTCGCCTCACCTCCGCCTGCCTCTCCCGGCCATAAGCTATAAAAGCAGTAGCTGCGGCTGTCGTCCCCCTCTTCCACCCGCC...

XR_009094065.1
CTAAATTATTACAAACCTTTTTACGATTTTCATCTTCGTAAACACGCTTACTCTTCTGATTCTCTCCTTCTCTCTGCGCTTCCTCTCACCAATTCCCCAACTCTCCATAACCCGTCCCCTCTGCCGGCGGCCACCCTACCTGGCTCATCCGCGACTTGGCGTCGCCGCTCGCCTTCCTCGCCTCACCTCCGCCTGCCTCTCCCGGCCATAAGCTATAAAAGCAGTAGCTGCGGCTGTCGTCCCCCTCTTCCACCCGCCTC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131001906
ATGTCTCTCGCCAACCGATTTCTCTGCAGGAACGGTGTCGTAACACCTGCAGCTGACACTCCTCCAGTTGCAGCTTTCCTTGAAGCTCAACCAGGTGTATATACAACCACTCGCACCCACAACAATGTCTCGGAACTCTTATTCTGGGAAAGACATCTAAGTAGGCTATCAAATTCCTTCAAATTGTTGTTGAGAGAAAATCCAAACTTATTACTCCAAAACCCCAGAAACGATAGTGCTATATTTTGGGAATTGTCGAC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057784524.1
MSLANRFLCRNGVVTPAADTPPVAAFLEAQPGVYTTTRTHNNVSELLFWERHLSRLSNSFKLLLRENPNLLLQNPRNDSAIFWELSTRSAMWDSVIRCLVHDSMRKVMPLVVRDRNSVEEMAFTVLLSGNWENLDFRRGGFDEGRISEVLDVYLHVGGYIPAAFGSRESAASLAVVGRGRDFANAKYTDWVRLRKHLERLRPPSITELLLSNDGERILEGCVTNFFVVSLKEKDGDASTVEQNELQSSSGIEVQTAPLSD...

XP_057784525.1
MSLANRFLCRNGVVTPAADTPPVAAFLEAQPGVYTTTRTHNNVSELLFWERHLSRLSNSFKLLLRENPNLLLQNPRNDSAIFWELSTRSAMWDSVIRCLVHDSMRKVMPLVVRDRNSVEEMAFTVLLSGNWENLDFRRGGFDEGRISEVLDVYLHVGGYIPAAFGSRESAASLAVVGRGRDFANAKYTDWVRLRKHLERLRPPSITELLLSNDGERILEGCVTNFFVVSLKEKDGDASTVEQNELQSSSGIEVQTAPLSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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