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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002390`

染色体: Chr08 坐标: 22669739-22673380 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002390`
名称	SmilChr08G002390
描述	probable RNA-binding protein ARP1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	22669739 - 22673380 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001909`
GeneID	`131001909`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001909`
原始查询	`LOC131001909`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable RNA-binding protein ARP1
产物	probable RNA-binding protein ARP1
Arabidopsis	`AT3G54770` (ARP1) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824642] identity=54; qcov=0.912; evalue=2.83e-73; confidence=high
Rice	`Os03g0286500` - identity=48.2; qcov=1.08; evalue=6.64e-73; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001909

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057784534.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057784534.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784534.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784534.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057784534.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:22669967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr8:22670012`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr8:22670032`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B133
`Chr8:22670032`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B133
`Chr8:22670530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr8:22672147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B135,B35,C61,C62
`Chr8:22672198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,B44
`Chr8:22672397`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr8:22673033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784534.1

268 aa

134

268

RRM_1

PF00076 RRM_1 14-71 aa

XP_057784535.1

264 aa

132

264

RRM_1

PF00076 RRM_1 14-71 aa

XP_057784536.1

262 aa

131

262

RRM_1

PF00076 RRM_1 14-71 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784534.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	14	71	2e-17	63.5	RNA recognition motif
`XP_057784535.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	14	71	1.9e-17	63.6	RNA recognition motif
`XP_057784536.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	14	71	1.9e-17	63.6	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928553.1
CGCTGTAATTACAAAATCAATCAAAAACAGTAATCATGTTAATACATGAGAGAGAGAGAGAGAGCATTCAAGTGTTCATGTTGGCCTCAACCCAAAATCCATCTGTCTGCCCCTCTGTCACTTTCCTTTATTATATTCCAATGTATACATACATCCTCCACATTACTTATATTTCTCCATTCCCATCAACTCTCCTCCTCCTACAATGACAATGATCACCTTGGGCGACACCTCTCTCACCAAAGTCTTCGTGGGCGGCC...

XM_057928552.1
CAACCCAAAATCCATCTGTCTGCCCCTCTGTCACTTTCCTTTATTATATTCCAATGTATACATACATCCTCCACATTACTTATATTTCTCCATTCCCATCAACTCTCCTCCTCCTACAATGACAATGATCACCTTGGGCGACACCTCTCTCACCAAAGTCTTCGTGGGCGGCCTCGCTTGGGAGACCCCCAAGGAAGCCATGAAAGACCACTTCCAGAAATACGGCGACATTCTCGAAGCCGTCATCATCTCCGACAAGC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131001909
ATGACAATGATCACCTTGGGCGACACCTCTCTCACCAAAGTCTTCGTGGGCGGCCTCGCTTGGGAGACCCCCAAGGAAGCCATGAAAGACCACTTCCAGAAATACGGCGACATTCTCGAAGCCGTCATCATCTCCGACAAGCTCACCGGCCGATCCAAGGGCTACGGCTTCGTCACTTTCAAGGACGCCGATGCGGCCAAGAAAGCCTGCGAGGACCCCACTCCGATCATCAACGGCCGCCGCGCCAACTGCAACCTCGC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057784534.1
MTMITLGDTSLTKVFVGGLAWETPKEAMKDHFQKYGDILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDADAAKKACEDPTPIINGRRANCNLAVLGARRPRSSSTNPPPQQGVNVGPRAAASTPPPPPPPPSNHVQWYYPAAAPATAAAAAPFHHHNNHHHHQAVPIYGYSPTYITAADMNYNHKVGFTGGSYMNGHFGQVYPAGQTMVGAGALMPMYPYYHFHQSQSMGLPAHLYCPTAAGPIPTVPALISKPTSIAPPNAGNYY...

XP_057784535.1
MTMITLGDTSLTKVFVGGLAWETPKEAMKDHFQKYGDILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDADAAKKACEDPTPIINGRRANCNLAVLGARRPRSSSTNPPPQQGVNVGPRAAASTPPPPPPPPSNHVQWYYPAAAPATAAAAAPFHHHNNHHHHQAVPIYGYSPTYITAADMNYNHKVGFTGGSYMNGHFGQVYPAGQTMVGAGALMPMYPYYHFHQSQSMGLPAHLYCPTAAGPIPTVPALISKPTSIAPPNAGTTI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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