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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002405`

染色体: Chr08 坐标: 22850689-22852992 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002405`
名称	SmilChr08G002405
描述	ammonium transporter 1 member 2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	22850689 - 22852992 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001924`
GeneID	`131001924`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001924`
原始查询	`LOC131001924`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ammonium transporter 1 member 2-like
产物	ammonium transporter 1 member 2-like
Arabidopsis	`AT1G64780` (AMT1;2) ammonium transporter 1;2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842786] identity=82.5; qcov=0.905; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0620600` (AMT1) - identity=75.7; qcov=0.96; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008519 (ammonium channel activity); GO:0016020 (membrane); GO:0072488 (ammonium transmembrane transport); GO:0097272 (ammonium homeostasis)
KEGG	-
Pfam	PF00909 (Ammonium_transp)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001924

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057784557.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.60000	`XP_057784557.1`
3	Phagosome	Phagosome	0.40000	`XP_057784557.1`
4	Endosome	内体	0.40000	`XP_057784557.1`
5	Endosome membrane	内体膜	0.40000	`XP_057784557.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:22851299`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr8:22851338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:22851503`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,C86
`Chr8:22851521`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B24,B78,C46
`Chr8:22851530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr8:22851564`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B54
`Chr8:22851564`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B54
`Chr8:22852547`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B73
`Chr8:22852547`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B73
`Chr8:22852670`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B24,B78,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784557.1

505 aa

252

505

Ammonium_transp

PF00909 Ammonium_transp 51-472 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784557.1`	Pfam	`PF00909`	Ammonium_transp	Family	51	472	5e-130	434.5	Ammonium Transporter Family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928574.1
TGTGGACAATGTTAGGTGAATAAAATTTTCGTTCACTAAATTATATGGGCTGGAACTGGAATGGACCATTAACTCTAAGAAAGAGTTTGGTTTTACATTTGGCTGTAGCCTCAAGTCTATAAAAAGCCAATCTTGAATAAATTGGCGGTTGCAGTTGGGCAAACAACCCCCACCCCGAAATCATGGCGGACCCGCTAAGCTGCACGGCGACAGACCTCCTCCCCCTCCTCGGCGGCTCCCCAAACGCCACCGCCGCCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001924
ATGGCGGACCCGCTAAGCTGCACGGCGACAGACCTCCTCCCCCTCCTCGGCGGCTCCCCAAACGCCACCGCCGCCGCCACCTTCTTATGCAGCCGTTTCGCCGCAGTATCGGCGAAGCTGAGCGACGCCACATACGCCATCGACAACACTTACCTCCTCTTCTCGGCTTACCTGGTGTTCGCCATGCAGCTGGGCTTCGCGATGCTCTGCGCCGGCTCGGTCCGCGCCAAGAACACCATGAACATCATGCTCACCAACGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784557.1
MADPLSCTATDLLPLLGGSPNATAAATFLCSRFAAVSAKLSDATYAIDNTYLLFSAYLVFAMQLGFAMLCAGSVRAKNTMNIMLTNVLDAAAGGLSYYLFGYAFAFGGPSNGFIGKHFFGLKEFPSPTADYSLFLYQWAFAIAAAGITSGSIAERTQFVAYLIYSSFLTGFVYPVVSHWFWSGDGWAGAGKSGGGLLFGSGAIDFAGSGVVHMVGGIAGLWGALIEGPRIGRFDRSGRSVALRGHSSSLVVLGTFLLWFG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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