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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002406`

染色体: Chr08 坐标: 22857697-22861857 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002406`
名称	SmilChr08G002406
描述	uncharacterized SmilChr08G002406
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	22857697 - 22861857 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001925`
GeneID	`131001925`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001925`
原始查询	`LOC131001925`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	carboxyl-terminal peptidase (DUF239) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831964]; symbol=AT5G18460; hit=AT5G18460; species=arabidopsis; confidence=high
产物	carboxyl-terminal peptidase (DUF239) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831964]; symbol=AT5G18460; hit=AT5G18460; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G18460` (AT5G18460) carboxyl-terminal peptidase (DUF239) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831964] identity=70.6; qcov=0.891; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0566100` - identity=61.8; qcov=0.862; evalue=1.35e-171; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03080 (Neprosin); PF14365 (Neprosin_AP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001925

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057784558.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057784558.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057784558.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784558.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784558.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:22858132`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr8:22858133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,B44
`Chr8:22858151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,B44
`Chr8:22858786`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr8:22858787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,B44
`Chr8:22859347`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:22859370`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr8:22859395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:22859398`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B30,B84,C59,C81
`Chr8:22859411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B57
`Chr8:22859412`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr8:22859474`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784558.1

458 aa

229

458

Neprosin_AP

Neprosin

PF14365 Neprosin_AP 90-214 aa PF03080 Neprosin 239-451 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784558.1`	Pfam	`PF14365`	Neprosin_AP	Family	90	214	3.9e-41	141.0	Neprosin activation peptide
`XP_057784558.1`	Pfam	`PF03080`	Neprosin	Family	239	451	4e-88	295.1	Neprosin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928575.1
AAAATGATTTATTATAATGCTTAAAATTTTATATATATATATATATAGCTCTACTTTTTCTTCTTTTTCTCTCCTCTGCTTAGCCTCATTCTTCCATTGTGTGTGTGTGTGTGAAAGAGCAAATGTTATTCTATCATTGCTGGACATAATCCCATGCAGTATTTACCAGAACTGCAGCTAGCTATATTATGTTACCCAGTGTGTGTTGAGTCAAGAATTGATGAATAGAAGTCAATTTCCAAAAAAAAAAAAATGGTTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001925
ATGAATAGAAGTCAATTTCCAAAAAAAAAAAAATGGTTTAAAATAGTTGTGTGTGGGGTTTCTTGGGCATTGAATGAAATGGGAATTGCTGCTGATAAAAGAGGATTTTCAATAATTCCTCTTCTTGTGCTATCTTTTGTTGCAATCTTGTGCCAAAAATCATTAGCCATTTCCACTTTCAACCATACAAATTACAAACAAATTAGCAGCTTGAGACAAGCCAGAATTCAGAGGCATTTAGACAAGATCAACAAGCCTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784558.1
MNRSQFPKKKKWFKIVVCGVSWALNEMGIAADKRGFSIIPLLVLSFVAILCQKSLAISTFNHTNYKQISSLRQARIQRHLDKINKPPVLTIESPDGDIIDCVHKRRQPALDHPLLKHHKIQRVASKMPKGVKMDDKSNRSRSVDGFRGVWQMWHQKGQLCPKGTVPIRRSAMQDVMRAKSLYDFGKKSPQFLPLASTAAAPDIAGSGHEHAIAYTTSSDEIYGAKATINVWDPAVEHSNEFSLAQIWVLSGSFDGSDLNS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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