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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002411`

染色体: Chr08 坐标: 22900980-22902097 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002411`
名称	SmilChr08G002411
描述	dehydration-responsive element-binding protein 2D-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	22900980 - 22902097 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001930`
GeneID	`131001930`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001930`
原始查询	`LOC131001930`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dehydration-responsive element-binding protein 2D-like
产物	dehydration-responsive element-binding protein 2D-like
Arabidopsis	`AT5G18450` (AT5G18450) Integrase-type DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831963] identity=73.4; qcov=0.508; evalue=5.22e-42; confidence=medium
Rice	`Os08g0565200` (OsERF#044) - identity=71.8; qcov=0.459; evalue=7.82e-40; confidence=medium
GO	GO:0000976 (transcription cis-regulatory region binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006950 (response to stress); GO:0045893 (positive regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00847 (AP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001930

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057784562.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784562.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784562.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057784562.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057784562.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:22901440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr8:22901620`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:22901647`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,C16,C43,C87
`Chr8:22901707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr8:22901735`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B72,C26
`Chr8:22901747`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr8:22901767`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C16
`Chr8:22901767`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C16
`Chr8:22901788`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,C19
`Chr8:22901828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr8:22901882`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784562.1

185 aa

185

AP2

PF00847 AP2 39-87 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784562.1`	Pfam	`PF00847`	AP2	Domain	39	87	1.4e-14	54.8	AP2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928579.1
CACAGAAAAGACGTCAACGAAGGCCAACCCCACCCCCCATCCAACCCCCCCACCCTAAAGGTCATCACCGCCACCCCAACCCTTTAAATTCCGCCACCACACTCTTCAGCCACTCTACAACTTCGACGACGAACCCCTCACTTTTCCGGCGACAACCGACAGTCTCAGCGCCGCCGCAAAACGACGGATGCCCCCCCAACCCCCCACCCACACAGCGCCGGAGAAGAGATCCGCCGCCGTCCGCCGCTCCAGGAAGGGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001930
ATGCCCCCCCAACCCCCCACCCACACAGCGCCGGAGAAGAGATCCGCCGCCGTCCGCCGCTCCAGGAAGGGCTGCATGCGCGGAAAAGGCGGGCCGGAAAACGCCCTCTGCACCTACCGCGGCGTCCGGCAGCGGACATGGGGAAAATGGGTGGCGGAAATCCGCGAGCCCAACCGCGGCGCCAGGGTTTGGCTCGGCACCTTCAACACCTCCCTCGAGGCGGCGCAGGCCTACGACGACGCTGCCCGCCGCCTCTACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784562.1
MPPQPPTHTAPEKRSAAVRRSRKGCMRGKGGPENALCTYRGVRQRTWGKWVAEIREPNRGARVWLGTFNTSLEAAQAYDDAARRLYGAGAKLNLQEPDSGGGRNMQTPAAQPAVSPSCTDSVVPDYYDNYYRSESSVLDEARSMWDIPAAPTLLDEKQSLNWPEFPPESFSKCDFMDDTRVPWTL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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