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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004387`

染色体: Chr01 坐标: 62044115-62047497 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004387`
名称	SmilChr01G004387
描述	eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	62044115 - 62047497 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001935`
GeneID	`131001935`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001935`
原始查询	`LOC131001935`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E
产物	eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E
Arabidopsis	`AT3G57290` (EIF3E) eukaryotic translation initiation factor 3E [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824896] identity=82.5; qcov=0.991; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0222300` (EIF3E) - identity=72; qcov=0.977; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003743 (translation initiation factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005852 (eukaryotic translation initiation factor 3 complex); GO:0006413 (translational initiation)
KEGG	-
Pfam	PF01399 (PCI); PF09440 (eIF3_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001935

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057784568.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057784568.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057784568.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784568.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784568.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:62045227`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,C43,D2
`Chr1:62045612`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr1:62045652`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B90,B92
`Chr1:62046580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr1:62046664`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B63,C2,C27,D10
`Chr1:62047225`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784568.1

438 aa

219

438

eIF3_N

PCI

PF09440 eIF3_N 6-138 aa PF01399 PCI 307-400 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784568.1`	Pfam	`PF09440`	eIF3_N	Domain	6	138	7.7e-52	175.9	eIF3 subunit 6 N terminal domain
`XP_057784568.1`	Pfam	`PF01399`	PCI	Domain	307	400	3.3e-16	60.0	PCI domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928585.1
GTATCACTCTATTTACACTACACTGCTGTCAATATATTGTACTCTCATTAATAGTAGTAATAGGAATTATTTAAAAAGACACCGTTCAAAAAAGAAAAAGAAAAAAGGAATTATTAAAAACCCTAGTTCCCAAACCCAAATCAGATAAATTTTTTCGTTCCAGAATCAATCCAGGCCTTCCAGCGCCGCCGCAAAACCACCGCTTCAGTCAGTTAACGGAGACAATGGCGTCGCAATACGACCTGACGCCGCGGATAGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001935
ATGGCGTCGCAATACGACCTGACGCCGCGGATAGCGCCGCATCTAGACAGGCATCTGGTGTTCCCGCTACTCGAGTTCCTACAGGAGAGAGGGTTGTACCCTGAGGAAGATATTTTGAAGGCGAAGATTGAGCTGCTCAACCACACTAACATGGTTGATTACGCCATGGATATTCATAAATCTCTCTACCGATCGGACGATGTTCCTCAAGACATGATCGATAGGAGAGCTGAGGTGGTGGGTAGGCTGAAGGCGTTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784568.1
MASQYDLTPRIAPHLDRHLVFPLLEFLQERGLYPEEDILKAKIELLNHTNMVDYAMDIHKSLYRSDDVPQDMIDRRAEVVGRLKALEDGAAPLIAFLQNPHAVQELRADKQYNLQMLNERYQIGAEQIDALYDYAKFQFECGNYSGAADYLYQYRALCTNSDKSLSALWGKLAAEVLMQNWDIALEELNRLKEIIDSKNFSSPLNQVQSRIWLMHWSLFIFFNHDNGRTQIIDLFNQDKYLNAIQTNAPHLLRYLATAFI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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