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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002420`

染色体: Chr08 坐标: 22993606-22997966 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002420`
名称	SmilChr08G002420
描述	CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase 2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	22993606 - 22997966 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001939`
GeneID	`131001939`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001939`
原始查询	`LOC131001939`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase 2-like
产物	CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase 2-like
Arabidopsis	`AT3G55030` (PGPS2) phosphatidylglycerolphosphate synthase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824669] identity=66.7; qcov=0.678; evalue=2.25e-97; confidence=high
Rice	`Os03g0283600` - identity=74.9; qcov=0.587; evalue=2.13e-100; confidence=medium
GO	GO:0008444 (CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase activity); GO:0009941 (chloroplast envelope); GO:0016020 (membrane); GO:0046474 (glycerophospholipid biosynthetic process)
KEGG	smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01066 (CDP-OH_P_transf)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001939

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057784570.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.80000	`XP_057784571.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.80000	`XP_057784571.1`
4	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057784570.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784570.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:22993908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B76
`Chr8:22993908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr8:22994164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:22994847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr8:22997292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784570.1

337 aa

168

337

CDP-OH_P_transf

PF01066 CDP-OH_P_transf 139-321 aa

XP_057784571.1

332 aa

166

332

CDP-OH_P_transf

PF01066 CDP-OH_P_transf 139-316 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784570.1`	Pfam	`PF01066`	CDP-OH_P_transf	Family	139	321	1e-29	104.6	CDP-alcohol phosphatidyltransferase
`XP_057784571.1`	Pfam	`PF01066`	CDP-OH_P_transf	Family	139	316	4.6e-30	105.8	CDP-alcohol phosphatidyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928588.1
AAATAAATCTAAAATATCTCAGCACGCTCAAAACGGCAGCCATAATTGCCAAATCTCCTTCTCCACCTGGCCTGCGCTGCTAAAATAAGCATCCTCGCTAACTTGAGCCCCCCGCGCGCATTTTAATCCATACCCACCACCATCATCATGCCAGGCGCCCTCAAACTCACAAATTTCACCATTCTCCACGCCCATAAACCCTACAGATTGCTCGTCAATTTATCCTCTCCCTCCCACGCCGCTGCCGCCGCTGCCACCGT...

XM_057928587.1
AGCACGCTCAAAACGGCAGCCATAATTGCCAAATCTCCTTCTCCACCTGGCCTGCGCTGCTAAAATAAGCATCCTCGCTAACTTGAGCCCCCCGCGCGCATTTTAATCCATACCCACCACCATCATCATGCCAGGCGCCCTCAAACTCACAAATTTCACCATTCTCCACGCCCATAAACCCTACAGATTGCTCGTCAATTTATCCTCTCCCTCCCACGCCGCTGCCGCCGCTGCCACCGTCGATTCAAGGAATATCCCGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131001939
ATGCCAGGCGCCCTCAAACTCACAAATTTCACCATTCTCCACGCCCATAAACCCTACAGATTGCTCGTCAATTTATCCTCTCCCTCCCACGCCGCTGCCGCCGCTGCCACCGTCGATTCAAGGAATATCCCGCGGCTCAGCTATCTCTCCGGCTGGCGGTGCAGGACAACCCCATTCCAGACCCCCGCGCACGTTAGCACAACCCTTAAATTCCAGAATCTCTGCTTCTACGCATCCGATTCCGGGAACGAAGGGAAATA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057784570.1
MPGALKLTNFTILHAHKPYRLLVNLSSPSHAAAAAATVDSRNIPRLSYLSGWRCRTTPFQTPAHVSTTLKFQNLCFYASDSGNEGKYGYFDRGRSDNLGTPMGAAVNGKVETAARDESDVPPPRSHGEKPPRKSSKLLTLPTILTIGRVAAVPILVYILFSLAFYVESWWGPSATVGIFVAAATTDWLDGYLARKMKLGTPFGAFLDPVADKLMVATTLILLCTKPLEAGIFGHEPWLLTVPATAIICREITMSAVREWA...

XP_057784571.1
MPGALKLTNFTILHAHKPYRLLVNLSSPSHAAAAAATVDSRNIPRLSYLSGWRCRTTPFQTPAHVSTTLKFQNLCFYASDSGNEGKYGYFDRGRSDNLGTPMGAAVNGKVETAARDESDVPPPRSHGEKPPRKSSKLLTLPTILTIGRVAAVPILVYTFYVESWWGPSATVGIFVAAATTDWLDGYLARKMKLGTPFGAFLDPVADKLMVATTLILLCTKPLEAGIFGHEPWLLTVPATAIICREITMSAVREWAASRDK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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