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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002421`

染色体: Chr08 坐标: 23000709-23004656 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002421`
名称	SmilChr08G002421
描述	probable protein phosphatase 2C 38
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	23000709 - 23004656 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001940`
GeneID	`131001940`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001940`
原始查询	`LOC131001940`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable protein phosphatase 2C 38
产物	probable protein phosphatase 2C 38
Arabidopsis	`AT3G12620` (AT3G12620) Protein phosphatase 2C family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820442] identity=76; qcov=0.996; evalue=3.47e-149; confidence=high
Rice	`Os06g0717800` (OsPP2C60) - identity=71.7; qcov=0.974; evalue=2.61e-140; confidence=high
GO	GO:0004722 (protein serine/threonine phosphatase activity); GO:0006470 (protein dephosphorylation); GO:0043169 (cation binding)
KEGG	-
Pfam	PF00481 (PP2C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001940

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057784573.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057784573.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057784572.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057784573.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784572.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:23001437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,B44
`Chr8:23002099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr8:23002615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B135,B35,B46,C61,C62
`Chr8:23003526`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784572.1

391 aa

196

391

PP2C

PF00481 PP2C 75-329 aa

XP_057784573.1

272 aa

136

272

PP2C

PF00481 PP2C 4-210 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784572.1`	Pfam	`PF00481`	PP2C	Family	75	329	8.3e-40	137.8	Protein phosphatase 2C
`XP_057784573.1`	Pfam	`PF00481`	PP2C	Family	4	210	2.7e-34	119.7	Protein phosphatase 2C

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928589.1
CGTGTCATGTGTGTGTGTGAGAGAGAGGGAGAGAGATAGGTTGAAAGAGATTTTCATTCTTTCTCACTAGCTTTTTTGACCTTTTATGGCTAAAAAAGGAAAAAGTGCAGACGGGGAAAATAATGCCAACTAAATTTCATTTCGGGGTGAGAAATGAAATTTCTAGATTATAAAGGGGTGGAGTGAAATTATTCCCACCTCGAAGGTGCAAGGAGCAATTCAAAGAATGCAGAGGAATTTTTTAAGATCTCCAAAAACCC...

XM_057928590.1
GATCAAAGCCAGCTTGAGTCGGGGCCACTGAGCTCGAATGAGTCAGGCCCTTATGGTACATTCGTTGGAGTTTATGACGGGCATGGTGGTCCAGAAACTGCACGGTTTATAAGAGATCGTCTGTTTGAAAATTTAAGAACTTTCGTGATGCAGAATTCACATCAGAAAATCGAGAGATGTCAGCTGATGTTATAAAAAATGCATTTCTGGCAACAGAGGAAGAATTTCTTTCTTTGGTTAGGAAGCAATGGGACATTACA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131001940
ATGGTGACCCCTACATGGAAGAAGCTCGTGCCCCCATGTTGGAGGCCGTTCGTGGAGGACGAAGGAGAGAACAGTAGCAACGGAGGAGGTGACTCTAGCGGCCATGCTGACAGTTTGTGGTGGCACAAGGATTACGGGCACCATCATAACGGGGAATTCTCTATGGCAGTTATTCAAGCCAATGTTATTCTAGAAGATCAAAGCCAGCTTGAGTCGGGGCCACTGAGCTCGAATGAGTCAGGCCCTTATGGTACATTCGT...

LOC131001940
ATGTCAGCTGATGTTATAAAAAATGCATTTCTGGCAACAGAGGAAGAATTTCTTTCTTTGGTTAGGAAGCAATGGGACATTACACCAAAACTGGCATCTGTGGGGTCATGTTGTTTGGTGGGCGTTATATGCGGTGGACAGTTATACATAGCAAATGCCGGAGATTCTAGGGTGGTCTTGGGACGATTGTCTAAGGCTGAACGAGAAGTCAAAGCTATTCAATTATCAACTGAACATAATGCAAATTTGGCATCTGTTCG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057784572.1
MVTPTWKKLVPPCWRPFVEDEGENSSNGGGDSSGHADSLWWHKDYGHHHNGEFSMAVIQANVILEDQSQLESGPLSSNESGPYGTFVGVYDGHGGPETARFIRDRLFENLRKFTSENREMSADVIKNAFLATEEEFLSLVRKQWDITPKLASVGSCCLVGVICGGQLYIANAGDSRVVLGRLSKAEREVKAIQLSTEHNANLASVRDELHTLHPDDPGIVVLKHNVWRVKGIIQVSRSIGDAYLKKSEFNKPPLLPKFRL...

XP_057784573.1
MSADVIKNAFLATEEEFLSLVRKQWDITPKLASVGSCCLVGVICGGQLYIANAGDSRVVLGRLSKAEREVKAIQLSTEHNANLASVRDELHTLHPDDPGIVVLKHNVWRVKGIIQVSRSIGDAYLKKSEFNKPPLLPKFRLPEPFEKPFLLAEPSILVQELHPQDEFLIFASDGLWEHLSNQEAVDIVNSSPRNGIARKLVKAALQEAAKKREMRYSDLKRIDRGVRRHFHDDITVIVLFLDSNLISSSSSSLRGPVLSI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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