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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002425`

染色体: Chr08 坐标: 23022644-23029154 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002425`
名称	SmilChr08G002425
描述	WPP domain-associated protein-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	23022644 - 23029154 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001945`
GeneID	`131001945`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001945`
原始查询	`LOC131001945`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	WPP domain-associated protein-like
产物	WPP domain-associated protein-like
Arabidopsis	`AT5G14990` (AT5G14990) WPP domain associated protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831351] identity=36.9; qcov=0.192; evalue=1.06e-16; confidence=weak
Rice	`Os12g0612300` - identity=29.2; qcov=0.221; evalue=4.26e-13; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001945

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057784576.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057784576.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057784576.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784576.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784576.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:23022854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr8:23023280`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,C41
`Chr8:23023389`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	113	A1,A10,A14,A15,A19,A21,A23,A25,A4,A9,B100,B101,B103,B105,B108,B11,B110,B111,B113,B115,B117,B119,B12,B123,B124,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B132,B133,B136,B137,B139,B17,B18,B19,B20,B21,B22,B26,B28,B34,B37,B4,B45,B48,B49,B5,B51,B53,B54,B56,B58,B59,B61,B66,B68,B69,B76,B77,B8,B83,B86,B9,B95,B96,B98,C10,C12,C14,C17,C18,C19,C2,C24,C26,C29,C3,C32,C35,C36,C39,C40,C45,C49,C50,C52,C53,C54,C58,C6,C61,C65,C68,C7,C71,C77,C78,C80,C83,C84,C85,C87,D1,D10,D11,D2,D4,D6,D7
`Chr8:23023853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B15,B3,B86,C64,C66
`Chr8:23023888`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,C41
`Chr8:23024091`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B102,B11
`Chr8:23024091`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B102,B11
`Chr8:23024114`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B1,B103,B46,B52,C85
`Chr8:23024114`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B1,B103,B46,B52,C85
`Chr8:23024116`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B1,B103,B46,B52,C85
`Chr8:23024116`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B1,B103,B46,B52,C85
`Chr8:23024213`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,C16,C43

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928593.1
AGAAGTAGATCAAATCGAGGCATGAAAGAATACTTGTTCGAAATCATCAATGCAAACCCAAAATAGGTCCATACTGCTCAATTTCTCCATCCATTCTCAATCACAAGCTTAATCTGTGTGATGCCTCGATCTAAGAAGCATTACCTTCGAACGAGGTAGTTACGTTAATTAGCCGGATCTTGTTATCATGGACGATTTAATCGGACAGATCAACTGCGGATCAAAGCTAGATTCAATAATGATGAGGATGTTGAGATCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001945
ATGGACGATTTAATCGGACAGATCAACTGCGGATCAAAGCTAGATTCAATAATGATGAGGATGTTGAGATCTGCCATGGACAAAGCTCACGAAAAGCTCCAGTTCAAGGACAGACCAATCGAGTTCTTACACGAACAAACGACATTCTACGAACTCGCAGCAATCTTGGTCGAAGGTAGCCTGAAAATCGTTGAACAAGATGAGCCTCTGCAGGTTCTTCCAAGCAAGACTATCTCCGACTTGCTCAAGATCAGAGAGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784576.1
MDDLIGQINCGSKLDSIMMRMLRSAMDKAHEKLQFKDRPIEFLHEQTTFYELAAILVEGSLKIVEQDEPLQVLPSKTISDLLKIRERLVGRIRDMKRLIKEKDREFRERLENELRLREALEVTESESVQLYEKIGPGLMKMKDSVDEQVLNIKQKLEDEKMILDSEIRARSLDKGMLEDERNDRILKKKATRSHSNPNLCSYSLYCERRARRSHSNPNLSSDSLDKDRGLMLLKDEKMILNTEKKACSSSSNLIPCSLDK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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