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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002444`

染色体: Chr08 坐标: 23255588-23260138 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002444`
名称	SmilChr08G002444
描述	mRNA-decapping enzyme subunit 2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	23255588 - 23260138 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001963`
GeneID	`131001963`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001963`
原始查询	`LOC131001963`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mRNA-decapping enzyme subunit 2-like
产物	mRNA-decapping enzyme subunit 2-like
Arabidopsis	`AT5G13570` (DCP2) decapping 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831201] identity=75.4; qcov=0.847; evalue=1.58e-151; confidence=high
Rice	`Os02g0805900` (OsDCP2) - identity=64.5; qcov=0.991; evalue=1.87e-148; confidence=high
GO	GO:0000184 (nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay); GO:0000290 (deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA); GO:0003723 (RNA binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0030145 (manganese ion binding); GO:0140933 (5'-(N(7)-methylguanosine 5'-triphospho)-[mRNA] hydrolase activity)
KEGG	smil03018 (RNA degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00293 (NUDIX); PF05026 (DCP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001963

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057784605.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.80000	`XP_057784605.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.60000	`XP_057784605.1`
4	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057784605.1`
5	P-body	P-body	0.20000	`XP_057784605.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:23255950`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B26,B44,B97,C4
`Chr8:23255950`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B26,B44,B97,C4
`Chr8:23256022`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,C19
`Chr8:23256074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr8:23256928`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A23,A7,B120,B40,B48,B6,C22,C47,C66,C84
`Chr8:23256934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	118	A1,A11,A13,A15,A18,A2,A23,A4,A5,B104,B106,B107,B112,B114,B115,B120,B121,B133,B135,B140,B15,B16,B19,B23,B26,B27,B3,B31,B33,B35,B40,B41,B44,B47,B48,B49,B50,B52,B53,B56,B6,B61,B64,B65,B67,B68,B69,B71,B75,B76,B78,B8,B86,B87,B88,B89,B91,B94,B95,B97,B98,B99,C11,C12,C15,C16,C18,C21,C22,C23,C24,C25,C28,C3,C32,C33,C34,C35,C37,C39,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C51,C55,C56,C57,C60,C61,C62,C63,C64,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C72,C73,C74,C76,C78,C8,C80,C84,C86,C9,D1,D2,D3,D4,D5,D9
`Chr8:23256947`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	20	A18,A2,A23,A7,B120,B40,B48,B49,B52,B6,B87,B95,C22,C23,C3,C32,C44,C47,C66,C84
`Chr8:23257090`	`A`	`AT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	7	A7,B26,B49,C3,C33,C44,C66
`Chr8:23257156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:23258791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B72,C26
`Chr8:23258821`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	30	A11,A16,A5,B111,B120,B23,B27,B28,B37,B4,B44,B6,B60,B67,B73,B8,B87,B9,B95,B97,C25,C30,C34,C41,C50,C53,C67,C74,C8,C9
`Chr8:23258859`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	A11,A5,B120,B23,B4,B6,B67,B8,B95,C25,C34,C41,C53,C67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784605.1

321 aa

160

321

DCP2

NUDIX

PF05026 DCP2 21-103 aa PF00293 NUDIX 107-218 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784605.1`	Pfam	`PF05026`	DCP2	Domain	21	103	3.2e-30	104.9	Dcp2, box A domain
`XP_057784605.1`	Pfam	`PF00293`	NUDIX	Domain	107	218	2.6e-15	57.3	NUDIX domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928622.1
TTGATTTGTTTGTCGATTGTGGGTTTCGTGGTAATGGTATGACCCCTCTGTCACTCCATACAGAGAGAGAGAGAGCGAGACAGTGTGAGAGCGATTAATAGAAAAATGTCAGGTGCCCTCAATCGATCTTCGAGTGGTCCTACGAAGAATATCCTCCCTCCTCAAGAACTCCTCGACGATCTCTGCAGTCGGTTTGTTCTAAACGTGCCCAAGGAAGACCAGCAGTCTTTTGAGAGGATTTTGTTTCTAGTGGAGTACGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001963
ATGTCAGGTGCCCTCAATCGATCTTCGAGTGGTCCTACGAAGAATATCCTCCCTCCTCAAGAACTCCTCGACGATCTCTGCAGTCGGTTTGTTCTAAACGTGCCCAAGGAAGACCAGCAGTCTTTTGAGAGGATTTTGTTTCTAGTGGAGTACGCCCACTGGTTTTATGAAGATAACTCTGTTGAAAAGAACCCATCACTGAAGTCATTGACTTTGAAGGAATTTACTTCCTTATTGTTTAACAATTGTGATGTTCTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784605.1
MSGALNRSSSGPTKNILPPQELLDDLCSRFVLNVPKEDQQSFERILFLVEYAHWFYEDNSVEKNPSLKSLTLKEFTSLLFNNCDVLKPYVPHIDDIFKDFTSYKFRVPVTGAIILDEAYERCLLVKGWKGSSWSFPRGKKNKDEEDHKCAIREVLEETGFDVSELLNEDDYIEMIFGQQRVRLYIVSGVKENTSFAPQTKKEISEIAWQRLDELQSASGDVISRGITGLKLYMVAPFLASLKSWISKHPPPIATMYDKPR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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