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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002469`

染色体: Chr08 坐标: 23594890-23599346 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002469`
名称	SmilChr08G002469
描述	dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1B
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	23594890 - 23599346 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001984`
GeneID	`131001984`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001984`
原始查询	`LOC131001984`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1B
产物	dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1B
Arabidopsis	`AT2G01720` (AT2G01720) Ribophorin I [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814701] identity=66.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0693000` - identity=65.5; qcov=0.95; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008250 (oligosaccharyltransferase complex); GO:0016020 (membrane); GO:0018279 (GO:0018279)
KEGG	smil00510 (N-Glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00513 (Various types of N-glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04597 (Ribophorin_I)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001984

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057784639.1`
2	Endoplasmic reticulum lumen	内质网腔	0.80000	`XP_057784639.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057784639.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784639.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784639.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:23595356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,B60
`Chr8:23596017`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B72,C26
`Chr8:23597243`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B36,C23
`Chr8:23597279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,C21,C65
`Chr8:23597294`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B36
`Chr8:23597722`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B23,B59
`Chr8:23597788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B36,C23
`Chr8:23597865`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C65
`Chr8:23597865`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C65
`Chr8:23597866`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,C39,C8
`Chr8:23598067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr8:23598086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B36,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784639.1

463 aa

232

463

Ribophorin_I

PF04597 Ribophorin_I 28-454 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784639.1`	Pfam	`PF04597`	Ribophorin_I	Family	28	454	1.4e-147	493.0	Ribophorin I

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928656.1
TCAGACAAACCAGTTGACGGGGCACGGCCTGCATAGAAGACTACTGAAACGCTCTCTACTCATCACTGTAGAGAGAGAAACTCACTAAATCTTCACCCCAATGGCAGCTGCAATTTTCTCTCTCTTCATATTCCTCGTCTTGCTGCTCGTCAAAACGTCTTCAGCCTCCTCCTCTGGCCTCCAGATCCTCCAGGCCGAGCGTCAGATTGAATTGACTTCGCACATTGTTAGGGTTTACCTGACATTGAAGATAGAGAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001984
ATGGCAGCTGCAATTTTCTCTCTCTTCATATTCCTCGTCTTGCTGCTCGTCAAAACGTCTTCAGCCTCCTCCTCTGGCCTCCAGATCCTCCAGGCCGAGCGTCAGATTGAATTGACTTCGCACATTGTTAGGGTTTACCTGACATTGAAGATAGAGAACACTGAGGATGCTCCAGCAACAGAAGTTCTCTTATCATTCCCACCTGCGCAGTTTGAGCATCTAGCATTGGTTAAAGCAGCTGTGACTGTCGGAAAAAAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784639.1
MAAAIFSLFIFLVLLLVKTSSASSSGLQILQAERQIELTSHIVRVYLTLKIENTEDAPATEVLLSFPPAQFEHLALVKAAVTVGKKRKKSYAPLEANPTEQPEAPNGTKYYSVSLLKPLAKGETTTLEILYVLTQSLEPFPVEITQSDPQLVYYHDSAIILSPYHIAHQATVVKTPSNNVESFTQVEPAHRSGSELRYGPYEGRDSYSYSPIIIHFENNHPFAVVEELEREIEISHWGSVQVTERYKLAHAGAKHKGAFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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