当前解析结果
SmilChr08G002477| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002477 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002477 |
| 描述 | non-classical arabinogalactan protein 30 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 23685673 - 23686407 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131001992 |
|---|---|
| GeneID | 131001992 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001992 |
| 原始查询 | LOC131001992 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | non-classical arabinogalactan protein 30 |
| 产物 | non-classical arabinogalactan protein 30 |
| Arabidopsis | AT5G05500 (MOP10)Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830433] identity=62.9; qcov=0.799; evalue=1.61e-66; confidence=high |
| Rice | Os01g0164300- identity=47.8; qcov=0.76; evalue=1.11e-43; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001992 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.80000 | XP_057784646.1 |
| 2 | Cell wall | 细胞壁 | 0.20000 | XP_057784646.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057784646.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057784646.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057784646.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:23685909 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A23,B119,B72,C26 |
Chr8:23686245 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B33,B49,B98,C32,C68 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。