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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004338`

染色体: Chr01 坐标: 61504998-61509396 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004338`
名称	SmilChr01G004338
描述	1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase 2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	61504998 - 61509396 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131002010`
GeneID	`131002010`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131002010`
原始查询	`LOC131002010`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase 2-like
产物	1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase 2-like
Arabidopsis	`AT3G57650` (LPAT2) lysophosphatidyl acyltransferase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824934] identity=72; qcov=0.984; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0637800` - identity=67.8; qcov=0.924; evalue=4.44e-165; confidence=high
GO	GO:0003841 (1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase activity); GO:0012505 (endomembrane system)
KEGG	smil00561 (Glycerolipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01553 (Acyltransferase); PF16076 (Acyltransf_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131002010

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057784673.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057784673.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057784673.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784673.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784673.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:61505113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	35	A20,A21,A23,A25,B102,B117,B121,B131,B133,B14,B17,B18,B28,B3,B35,B44,B54,B59,B64,B69,B73,B94,C17,C18,C25,C26,C36,C41,C47,C5,C52,C53,C73,C83,C84
`Chr1:61505601`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B21
`Chr1:61507734`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B124,B8,C22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784673.1

367 aa

184

367

Acyltransferase

Acyltransf_C

PF01553 Acyltransferase 82-214 aa PF16076 Acyltransf_C 239-309 aa

XP_057784679.1

367 aa

184

367

Acyltransferase

Acyltransf_C

PF01553 Acyltransferase 82-214 aa PF16076 Acyltransf_C 239-309 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784673.1`	Pfam	`PF01553`	Acyltransferase	Family	82	214	2.5e-14	54.0	Acyltransferase
`XP_057784673.1`	Pfam	`PF16076`	Acyltransf_C	Family	239	309	7.6e-22	77.8	Acyltransferase C-terminus
`XP_057784679.1`	Pfam	`PF01553`	Acyltransferase	Family	82	214	2.5e-14	54.0	Acyltransferase
`XP_057784679.1`	Pfam	`PF16076`	Acyltransf_C	Family	239	309	7.6e-22	77.8	Acyltransferase C-terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928696.1
AATCTTATCAGTCGAACTATTCAGTTACGGGTTATTTGAAAGCTAATTTTATTGGGTTAGAAATTTTTTAGCCCTAATCCTTTGGGATTATAGATTACAAGTTTCGAGTTAAATTGATATCCATGCTTATACAGTACAAGTGTACAACTCTATTACCTTCCTCCTCACCATTTCTCATAACTTCCGCCATTAGTATCACCTCTCTCTTCTTTCTTTCTATCTCTCTCACTCACTAAATGAGCCTCAGCATAGTATAGAGC...

XM_057928690.1
AATCTTATCAGTCGAACTATTCAGTTACGGGTTATTTGAAAGCTAATTTTATTGGGTTAGAAATTTTTTAGCCCTAATCCTTTGGGATTATAGATTACAAGTTTCGAGTTAAATTGATATCCATGCTTATACAGTACAAGTGTACAACTCTATTACCTTCCTCCTCACCATTTCTCATAACTTCCGCCATTAGTATCACCTCTCTCTTCTTTCTTTCTATCTCTCTCACTCACTAAATGAGCCTCAGCATAGTATAGAGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131002010
ATGGCGATTGCGCCGGCGATAGTGATTGTGCCCTTGGGAGTTTTCTTCTTCATCTCCGGCTTCATCGTCAATTTTATTCAGGCTGTATGTTTTGTGCTAATAAGACCGTTATCGAAGAACACTTATAGGAGGATAAATAAGGAGGTGGCTGAGCTACTGTGGCTCGAGCTCGTGTGGCTGGTTGACTGGTGGGCTGGTGTTAAGATTGAACTGTACACTGACTCTGAGACCTTTAATTTAATGGGTAAAGAACATGCACT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057784673.1
MAIAPAIVIVPLGVFFFISGFIVNFIQAVCFVLIRPLSKNTYRRINKEVAELLWLELVWLVDWWAGVKIELYTDSETFNLMGKEHALLICNHKSDIDWLVGWVLAQRAGCLGSSLAVMKKSLKFLPVIGWSMWFSEYLFLERSWATDESTLKSGLQRLRDFPRPFWLALFVEGTRFTQAKLLAAQEYASSNGLPVPRNVLIPRTKGFVASVSHMRSFVPAVYDATVAIPQNSPAPTILRLFSGQSSVVHVHLKRHLMSDL...

XP_057784679.1
MAIAPAIVIVPLGVFFFISGFIVNFIQAVCFVLIRPLSKNTYRRINKEVAELLWLELVWLVDWWAGVKIELYTDSETFNLMGKEHALLICNHKSDIDWLVGWVLAQRAGCLGSSLAVMKKSLKFLPVIGWSMWFSEYLFLERSWATDESTLKSGLQRLRDFPRPFWLALFVEGTRFTQAKLLAAQEYASSNGLPVPRNVLIPRTKGFVASVSHMRSFVPAVYDATVAIPQNSPAPTILRLFSGQSSVVHVHLKRHLMSDL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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