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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003765`

染色体: Chr08 坐标: 43080623-43083365 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003765`
名称	SmilChr08G003765
描述	uncharacterized SmilChr08G003765
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	43080623 - 43083365 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131002023`
GeneID	`131002023`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131002023`
原始查询	`LOC131002023`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/arginine repetitive matrix protein, putative (DUF936) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826968]; symbol=AT4G13370; hit=AT4G13370; species=arabidopsis; confidence=high
产物	serine/arginine repetitive matrix protein, putative (DUF936) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826968]; symbol=AT4G13370; hit=AT4G13370; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G13370` (AT4G13370) serine/arginine repetitive matrix protein, putative (DUF936) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826968] identity=51.5; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0120200` - identity=42.8; qcov=1.09; evalue=1.17e-157; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06075 (CORD_N); PF21647 (CORD_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131002023

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057784683.1`
2	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057784683.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.60000	`XP_057784683.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784683.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784683.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:43080861`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr8:43080918`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B99
`Chr8:43080918`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B99
`Chr8:43080927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,C3
`Chr8:43081015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr8:43081022`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C2
`Chr8:43081022`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C2
`Chr8:43081683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B33,B49,C32,C68,C73
`Chr8:43082371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B48,B65,C76
`Chr8:43082382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,C32,C68
`Chr8:43082530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B33,B49,C32,C68,C73
`Chr8:43082553`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B45,C34,C63,C67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784683.1

683 aa

342

683

CORD_N

CORD_C

PF06075 CORD_N 4-121 aa PF21647 CORD_C 414-681 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784683.1`	Pfam	`PF06075`	CORD_N	Domain	4	121	6.5e-48	162.2	CORD, N-terminal domain
`XP_057784683.1`	Pfam	`PF21647`	CORD_C	Domain	414	681	4e-85	286.9	CORD, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928700.1
ACCTCGAGTCTGCACCACCCGTCATCAACCCACAATACAAAGAAATGCTCCGTTTCAATTCCTTCCAACCCTAATTTCTCTCTCCAAGGAAGAAGAAGATACCCTCAATTCCCTTCCCGTCTCTCTCCAAAATGGCCTCTCTAACCCCCGGAATCCTCCTCAGGCTCCTCCAGTCCATGAACTCCACCACCAAAGTCACCGGCGACCACCGCAGCCCCCTCCTCCAGGTCATCGGAATCTTGCCCGCTCTCTCCGCCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131002023
ATGGCCTCTCTAACCCCCGGAATCCTCCTCAGGCTCCTCCAGTCCATGAACTCCACCACCAAAGTCACCGGCGACCACCGCAGCCCCCTCCTCCAGGTCATCGGAATCTTGCCCGCTCTCTCCGCCGCCGACTCCCTATGGCCGCACAACGGATTCTACGTCCAGCTCTCCGACTCTCTCAACTCCACCTACGTCTCCCTCTCCGACCGCGACACCGACCTCATCCTCAACAACCGCCTCCAATTAGGGCAATTTGTGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784683.1
MASLTPGILLRLLQSMNSTTKVTGDHRSPLLQVIGILPALSAADSLWPHNGFYVQLSDSLNSTYVSLSDRDTDLILNNRLQLGQFVHLDRLLFDSPPVPTPVNLRPLAGRQPFIGSPEPLIARISPNKNGFVIQPVSDSDPSADPITAYLSRAGKKETEGKEKFAEGKGSRLVIAPKKENVNVNVAANCGDESSNSSRSGSDKISQRFASPGALKQRPVSAGRKAVAAERDPSPAAKSGKRSSSPAPSKCVVPSLVVAKE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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