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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003775`

染色体: Chr08 坐标: 43271392-43278821 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003775`
名称	SmilChr08G003775
描述	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	43271392 - 43278821 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131002037`
GeneID	`131002037`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131002037`
原始查询	`LOC131002037`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8-like
产物	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8-like
Arabidopsis	`AT5G22030` (UBP8) ubiquitin-specific protease 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832263] identity=51.6; qcov=0.936; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0160000` - identity=48.9; qcov=0.835; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004843 (cysteine-type deubiquitinase activity); GO:0016579 (protein deubiquitination)
KEGG	-
Pfam	PF00443 (UCH); PF13423 (UCH_1); PF25242 (Ubiquitin_UBP8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131002037

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057784693.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057784693.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057784693.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784693.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784693.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:43273612`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B118,B125,C17,D9
`Chr8:43273623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B86,B9
`Chr8:43276404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr8:43276612`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:43277011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B24,C65
`Chr8:43278437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784693.1

934 aa

467

934

Ubiquitin_UBP8

UCH

UCH_1

PF25242 Ubiquitin_UBP8 204-257 aa PF00443 UCH 345-930 aa PF13423 UCH_1 346-526 aa PF13423 UCH_1 806-912 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784693.1`	Pfam	`PF25242`	Ubiquitin_UBP8	Domain	204	257	3.2e-18	65.8	UBP8-like, ubiquitin-like domain
`XP_057784693.1`	Pfam	`PF00443`	UCH	Family	345	930	2.3e-77	260.8	Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase
`XP_057784693.1`	Pfam	`PF13423`	UCH_1	Domain	346	526	2.1e-13	51.3	Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase
`XP_057784693.1`	Pfam	`PF13423`	UCH_1	Domain	806	912	2.1e-13	51.3	Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009094125.1
AACTAAATCTCGGGTCTATCTATTCGTCGATTTTATGACTTTTCCTTCCTTAACTCTCCCTCTCTCTATTTTTGTTTGGTTTTCAATTTTCAATTTGGTTTGTAGATGCTAGATGAGCCGTTGCCTGAAGCGACTCACCATTACTGCTGCTGTTAACAAAGCCCTTGAATTTCGATTCGGATTCCAATTTCCACCCCTTTTCCAACTGTTCAACCAATCAGCGACCTTGATTTTTTCTCTCCTCCGCCGTTCTCTCTCTA...

XR_009094126.1
AACTAAATCTCGGGTCTATCTATTCGTCGATTTTATGACTTTTCCTTCCTTAACTCTCCCTCTCTCTATTTTTGTTTGGTTTTCAATTTTCAATTTGGTTTGTAGATGCTAGATGAGCCGTTGCCTGAAGCGACTCACCATTACTGCTGCTGTTAACAAAGCCCTTGAATTTCGATTCGGATTCCAATTTCCACCCCTTTTCCAACTGTTCAACCAATCAGCGACCTTGATTTTTTCTCTCCTCCGCCGTTCTCTCTCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131002037
ATGAGCCGTTGCCTGAAGCGACTCACCATTACTGCTGCTGTTAACAAAGCCCTTGAATTTCGATTCGGATTCCAATTTCCACCCCTTTTCCAACTGTTCAACCAATCAGCGACCTTGATTTTTTCTCTCCTCCGCCGTTCTCTCTCTAAATCCATAAACCTCATGGACTCATTTTTCTTCAACAACGACGACGATGACCTTTTCTCAAACACTTTCGATCAATCATTTTTGCCGCCTTCATTTGCCGACCCCGGCGAATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784693.1
MSRCLKRLTITAAVNKALEFRFGFQFPPLFQLFNQSATLIFSLLRRSLSKSINLMDSFFFNNDDDDLFSNTFDQSFLPPSFADPGESLYLVSFRWWKEAACGGAVADETTGVCGVLYNATVQLNGHAPDESIGGFGDSEILVGLRREEEVGISGEEGNYSGEGDLALVSEWMFCTALKWHYDKKGMENSLPGEDSGHDLFSLQIRLMYVRETRHLVIKISKKDNGHGAFSKAYSIFTKLGMLQVWDFSRQTSQFFLNDSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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