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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003785`

染色体: Chr08 坐标: 43686170-43690544 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003785`
名称	SmilChr08G003785
描述	uncharacterized SmilChr08G003785
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	43686170 - 43690544 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131002040`
GeneID	`131002040`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131002040`
原始查询	`LOC131002040`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820349]; symbol=AT3G11760; hit=AT3G11760; species=arabidopsis; confidence=high
产物	structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820349]; symbol=AT3G11760; hit=AT3G11760; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G11760` (AT3G11760) structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820349] identity=56.7; qcov=0.978; evalue=0.0; confidence=high
Rice	`Os03g0649000` - identity=50.07; qcov=0.978; evalue=0.0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10358 (NT-C2); PF28979 (DUF8490)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131002040

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057784694.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057784694.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:43686901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr8:43688202`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	A18,A2,A5,B122,B14,B84,C33,C5,C61,D10,D11,D5
`Chr8:43688229`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B82,B84,C33
`Chr8:43688287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B128,B17,C58,D1
`Chr8:43688290`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,C11,C69
`Chr8:43688447`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B14
`Chr8:43688447`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B14
`Chr8:43688517`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B49,C32,C68
`Chr8:43688563`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B14,D5
`Chr8:43688657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:43688690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr8:43688754`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B135,B67,B68,C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784694.1

737 aa

368

737

NT-C2

DUF8490

PF10358 NT-C2 18-157 aa PF28979 DUF8490 428-721 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784694.1`	Pfam	`PF10358`	NT-C2	Domain	18	157	9.2e-09	35.8	N-terminal C2 in EEIG1 and EHBP1 proteins
`XP_057784694.1`	Pfam	`PF28979`	DUF8490	Domain	428	721	6.7e-134	445.9	Domain of unknown function (DUF8490)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928711.1
TTTTCATTCAGTCACCTCTACACATGTAGCGTAGTATTTGATTATTCGACATGATTCTTTGTAATAGAAGCAAACTTTGTCTCTTTACAAAGTTAGGAGAATAGAAATGGAAATTTTACAAATTTAAGATGATGTGTTGGCTTATAAAACTAAATTTGGTGCGTGTAACGAGAAGTCCGCTTTATTTGCCAAGCCTGGAAAATAACGGCATACTTTCTCTCTCTCTCTCTAATCGGCGGCGTGAGGAGAGCTCTTGAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057784694.1_45000
ATGGTGGTGAAGATGATGAAATGGAGGCCATGGCCCCCTCTGATTTGCAGGAAATTTGAGGTGAGGATCACTGTGCACAAGCTGGAGGGGTGTGATTGGGTGTGCGTGGGCGCAGAGAAGGACAATGGTGGTCTCGCGGTGGAGATCAGGTGGAAGGGCCCCAAGATTTCGCTGGGAACATTTAGGAGGACTGTGAAGAGGAACTGTACAAGGGAAGAGGCGGTCAAGAGGGTTTGTGGTGATGGCCCAAACGACGGCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784694.1
MVVKMMKWRPWPPLICRKFEVRITVHKLEGCDWVCVGAEKDNGGLAVEIRWKGPKISLGTFRRTVKRNCTREEAVKRVCGDGPNDGVLVEWDEEFCNVCNFSGYKDNVFHPWEINFAVLQVCEGAKNKISVVGLGALNLAEYASKTKEQLIVVKIPLTVSNIAVEHHPSLFISLDLVELQGAQQSTDLVPVMPVPPASASGEASSMDKDEVSALKAALRKVKFITEYVSTRRPRKAGHEEEGSEGRYFSKSEDDEYAYPC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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