当前解析结果
SmilChr01G004378| 统一新 Gene ID | SmilChr01G004378 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G004378 |
| 描述 | UDP-URONIC ACID TRANSPORTER 1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 61977416 - 61980139 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131002043 |
|---|---|
| GeneID | 131002043 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131002043 |
| 原始查询 | LOC131002043 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | UDP-URONIC ACID TRANSPORTER 1-like |
| 产物 | UDP-URONIC ACID TRANSPORTER 1-like |
| Arabidopsis | AT5G04160 (AT5G04160)Nucleotide-sugar transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830294] identity=81.7; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os03g0286300- identity=72.3; qcov=0.977; evalue=3.88e-157; confidence=high |
| GO | GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0015297 (antiporter activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF03151 (TPT); PF08449 (UAA) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131002043 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 1.00000 | XP_057784699.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057784699.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057784699.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057784699.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057784699.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:61979440 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B13,B38,B39,B70 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057784699.1PF08449
UAA 9-302 aa
PF03151
TPT 11-299 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057784699.1 |
Pfam | PF08449 |
UAA | Family | 9 | 302 | 2.7e-13 | 50.5 | UAA transporter family |
XP_057784699.1 |
Pfam | PF03151 |
TPT | Family | 11 | 299 | 1.4e-44 | 153.4 | Triose-phosphate Transporter family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。