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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003788`

染色体: Chr08 坐标: 43720213-43721890 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003788`
名称	SmilChr08G003788
描述	uncharacterized SmilChr08G003788
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	43720213 - 43721890 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131002044`
GeneID	`131002044`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131002044`
原始查询	`LOC131002044`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0378800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0378800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G11890` (AT3G11890) Sterile alpha motif (SAM) domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820362] identity=35.4; qcov=1.04; evalue=2.38e-27; confidence=medium
Rice	`Os08g0378800` - identity=31.6; qcov=1.14; evalue=6.95e-29; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00536 (SAM_1); PF07647 (SAM_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131002044

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057784697.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784697.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784697.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057784697.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057784697.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:43721351`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr8:43721389`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B33,B49,C32,C68
`Chr8:43721389`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B33,B49,C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784697.1

212 aa

106

212

SAM_2

SAM_1

PF07647 SAM_2 148-203 aa PF00536 SAM_1 149-203 aa

XP_057784698.1

198 aa

198

SAM_2

SAM_1

PF07647 SAM_2 134-189 aa PF00536 SAM_1 135-189 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784697.1`	Pfam	`PF07647`	SAM_2	Domain	148	203	3.5e-10	40.6	SAM domain (Sterile alpha motif)
`XP_057784697.1`	Pfam	`PF00536`	SAM_1	Domain	149	203	7.6e-09	36.5	SAM domain (Sterile alpha motif)
`XP_057784698.1`	Pfam	`PF07647`	SAM_2	Domain	134	189	3.1e-10	40.8	SAM domain (Sterile alpha motif)
`XP_057784698.1`	Pfam	`PF00536`	SAM_1	Domain	135	189	6.7e-09	36.7	SAM domain (Sterile alpha motif)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928714.1
AAAATGTACTAGTATACACTATACAACTTAAGGAGCCCTAGTTTTATTTCTAAATCAGCTTGCGCCGCCATTATCTTCTCGATTCACCGGCACCGCTTCTGTCTTCTCTCTCTATTTTTCTTTTTAAGTTTCTTCATCTTCACTTTGCTTCTCTCTGCGTTGTCTTCTTCTTCTCTAATTTTCTTTTAAACTTCTTTATCTTCACTCTGCTTCTCTCTTGGTTGTCTTCTTCTTCTTCTACTTTCTATTTTCCCTCAAAC...

XM_057928715.1
ACACTATACAACTTAAGGAGCCCTAGTTTTATTTCTAAATCAGCTTGCGCCGCCATTATCTTCTCGATTCACCGGCACCGCTTCTGTCTTCTCTCTCTATTTTTCTTTTTAAGTTTCTTCATCTTCACTTTGCTTCTCTCTGCGTTGTCTTCTTCTTCTCTAATTTTCTTTTAAACTTCTTTATCTTCACTCTGCTTCTCTCTTGGTTGTCTTCTTCTTCTTCTACTTTCTATTTTCCCTCAAACCAAGATAATTCATAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131002044
ATGGGGATAGCCTCATCAGTTTCCTTAACGATCTTCGATCTCCCTTTTGCAGATATACAACTAATGGTAAAGCCAAAGCAGAGACAGCTCCATGGTGCCCCTGATGAGGGAGATTGGATGGTGGTGAAGAAGCAGAGAATCACAATTATAATCCCACCTTTACCTAATAAGAAGCACTCAGCAATGCCCTGTATAGGAGATGCTCAGCTGCAAGAAAAACCAACAGGCATCACCAACTCCCACTTGCAATGCTCCAGATC...

LOC131002044
ATGATTCTTGATATACAACTAATGGTAAAGCCAAAGCAGAGACAGCTCCATGGTGCCCCTGATGAGGGAGATTGGATGGTGGTGAAGAAGCAGAGAATCACAATTATAATCCCACCTTTACCTAATAAGAAGCACTCAGCAATGCCCTGTATAGGAGATGCTCAGCTGCAAGAAAAACCAACAGGCATCACCAACTCCCACTTGCAATGCTCCAGATCATCCACTGTTGAACCTCAAGCACCAAGTTTATCCCATCGTAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057784697.1
MGIASSVSLTIFDLPFADIQLMVKPKQRQLHGAPDEGDWMVVKKQRITIIIPPLPNKKHSAMPCIGDAQLQEKPTGITNSHLQCSRSSTVEPQAPSLSHRREGNDINPCSSIPRARQGMKIFGDSTSFLNQRMRASYLEKKIRKAGGLENWLISLGLARFIKVFQMRRVGKFQLANLTMQKLKDMGTDAVGPRRKLMHAIDCLCQPHCFHHI

XP_057784698.1
MILDIQLMVKPKQRQLHGAPDEGDWMVVKKQRITIIIPPLPNKKHSAMPCIGDAQLQEKPTGITNSHLQCSRSSTVEPQAPSLSHRREGNDINPCSSIPRARQGMKIFGDSTSFLNQRMRASYLEKKIRKAGGLENWLISLGLARFIKVFQMRRVGKFQLANLTMQKLKDMGTDAVGPRRKLMHAIDCLCQPHCFHHI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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