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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004347`

染色体: Chr01 坐标: 61615704-61616943 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004347`
名称	SmilChr01G004347
描述	tRNA-uridine aminocarboxypropyltransferase A
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	61615704 - 61616943 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131002126`
GeneID	`131002126`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131002126`
原始查询	`LOC131002126`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tRNA-uridine aminocarboxypropyltransferase A
产物	tRNA-uridine aminocarboxypropyltransferase A
Arabidopsis	`AT2G41750` (AT2G41750) DTW domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818774] identity=45.7; qcov=0.955; evalue=4.47e-67; confidence=high
Rice	`Os12g0142600` - identity=46.8; qcov=0.884; evalue=9.64e-64; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03942 (DTW)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131002126

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057784708.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784708.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784708.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057784708.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057784708.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:61615882`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr1:61615895`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr1:61615945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C5
`Chr1:61616038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B108,B66,B97,C23
`Chr1:61616422`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr1:61616478`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,C79
`Chr1:61616562`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23
`Chr1:61616714`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B79
`Chr1:61616766`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr1:61616860`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	16	A20,B106,B124,B126,B135,B25,B27,B38,B39,B63,B88,C13,C43,C61,C78,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784708.1

268 aa

134

268

DTW

PF03942 DTW 22-235 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784708.1`	Pfam	`PF03942`	DTW	Domain	22	235	5.7e-40	137.9	DTW domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928725.1
CAGAAATCGGCCCAATAATTTGGGCCGTGGTTTCATTAACACATCGCTCGATCGTATCTCGATACTCTAGCCCAATGGACCTGCCTGAAGAAACCTCCTCCTCAGCCGCCGCCGTCGGCGGTGATGTTCGCCGGCGAAGGACGTGCACGACTGGATGCGGCCGCCCTATAAACGTGTGCCTCTGCCACGCCCTCCCTTCAGCTCCTGTCCCCACGGCTACGCAGGTCGTCATCCTCCACCACCCCCACGAGCGCCGCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131002126
ATGGACCTGCCTGAAGAAACCTCCTCCTCAGCCGCCGCCGTCGGCGGTGATGTTCGCCGGCGAAGGACGTGCACGACTGGATGCGGCCGCCCTATAAACGTGTGCCTCTGCCACGCCCTCCCTTCAGCTCCTGTCCCCACGGCTACGCAGGTCGTCATCCTCCACCACCCCCACGAGCGCCGCCACAAACTCGCCACCGTCCCCGTCCTCGCCAAATGCCTCCGGAACTGCGAGATTATCGTCGGACGCAAGATGAAGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784708.1
MDLPEETSSSAAAVGGDVRRRRTCTTGCGRPINVCLCHALPSAPVPTATQVVILHHPHERRHKLATVPVLAKCLRNCEIIVGRKMKYGQSGLLDSLHDQASENPNLPLRRAVYLFPGPEALPFGEVSQMYSSLDDAGKEGLVLIVFDGTWKHAKEMMVASLSFLSKFAVQVCLNFDAAADGGTIFDSELILRKEPFAGCMSTMEAVARCLRVLEPDGADIESRIIEVLRAMVSLQACYLKPLRPRTKLVKNNAGQNKMNN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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