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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004415`

染色体: Chr01 坐标: 62298287-62300829 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004415`
名称	SmilChr01G004415
描述	regulatory protein NPR5-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	62298287 - 62300829 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131002438`
GeneID	`131002438`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131002438`
原始查询	`LOC131002438`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	regulatory protein NPR5-like
产物	regulatory protein NPR5-like
Arabidopsis	`AT2G41370` (BOP2) Ankyrin repeat family protein / BTB/POZ domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818735] identity=77.3; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0948900` (OsNPR5) - identity=71.7; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0099402 (plant organ development)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00023 (Ank); PF00651 (BTB); PF11900 (DUF3420); PF12796 (Ank_2); PF13606 (Ank_3); PF13857 (Ank_5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131002438

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057784930.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057784930.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057784930.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057784930.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057784930.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:62298891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:62298986`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B75,B93
`Chr1:62299968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr1:62300034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B82,B90,B92
`Chr1:62300096`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C14
`Chr1:62300096`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C14
`Chr1:62300099`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C14
`Chr1:62300099`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C14
`Chr1:62300105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C52
`Chr1:62300478`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784930.1

460 aa

230

460

BTB

DUF3420

Ank_2

Ank_3

Ank

Ank_3

Ank

Ank_5

PF00651 BTB 18-102 aa PF11900 DUF3420 188-244 aa PF12796 Ank_2 249-332 aa PF13606 Ank_3 271-295 aa PF00023 Ank 271-297 aa PF13606 Ank_3 303-331 aa PF00023 Ank 303-333 aa PF13857 Ank_5 304-342 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784930.1`	Pfam	`PF00651`	BTB	Domain	18	102	3.5e-15	56.8	BTB/POZ domain
`XP_057784930.1`	Pfam	`PF11900`	DUF3420	Repeat	188	244	3.9e-13	50.0	Domain of unknown function (DUF3420)
`XP_057784930.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	249	332	3.7e-13	50.6	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057784930.1`	Pfam	`PF13606`	Ank_3	Repeat	271	295	8.8e-11	41.7	Ankyrin repeat
`XP_057784930.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	271	297	1e-12	48.3	Ankyrin repeat
`XP_057784930.1`	Pfam	`PF13606`	Ank_3	Repeat	303	331	8.8e-11	41.7	Ankyrin repeat
`XP_057784930.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	303	333	1e-12	48.3	Ankyrin repeat
`XP_057784930.1`	Pfam	`PF13857`	Ank_5	Repeat	304	342	2.2e-10	41.4	Ankyrin repeats (many copies)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057928947.1
CCCAGACTAGCCATTTATATTACTTACATCCCTCTCTTTCTCTCTCTAGAAATATCTCACCAGTCACCACATAGGTAGATTGAAAGAGAGAAGAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTACAAGTTACAAGAAATAAGCACAGTCGATGATGAAAGAGTTGAAGAAGAGATGATGAAACGAAGGCACGAAGCTTAACCCCTGAATCTTGTCCACATAAAAAGAGAGAGAAACATCCATCAATCTACAGAGGAAAACACTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131002438
ATGAGCCCAGAGGAGTCGTTAAGATCTCTGTCCCTAGACTACCTGAACCTCCTGATCAACGGGCAGGCCTTCAGCGACGTCACCTTTAGCGTGGAGGGGCGTCTGGTCCACGCGCACCGCTGCATCCTGGCCGCCCGGAGCCTCTTCTTCCGGAAATTCTTCTGCGGGCCCGACGCCCAGTCGCCCCAGATGGGCCCCCCGCCGCGCGGCCCCGGCGTCATCCCGGTTAACTCCGTCGGCTACGAGGTCTTCCTTCTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784930.1
MSPEESLRSLSLDYLNLLINGQAFSDVTFSVEGRLVHAHRCILAARSLFFRKFFCGPDAQSPQMGPPPRGPGVIPVNSVGYEVFLLMLQFLYSGQVSIVPQKHEPRPNCGERACWHTHCTSAVDLALDTLSAARSFGVEQLALLTQKQLASMVEKASIEDVMKVLIASRKQEMHQLWTTCSHLVGKSGLPPEVLAKHLPIDVVAKIEELRLKSSLARRSLMPHHQQQQDLAGPDLDDQKIRRMRRALDSSDVELVKLMVM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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