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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004451`

染色体: Chr01 坐标: 62629453-62633736 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004451`
名称	SmilChr01G004451
描述	transcription factor-like protein DPB
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	62629453 - 62633736 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131002803`
GeneID	`131002803`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131002803`
原始查询	`LOC131002803`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor-like protein DPB
产物	transcription factor-like protein DPB
Arabidopsis	`AT5G03415` (DPB) Transcription factor DP [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831847] identity=74; qcov=0.803; evalue=1.29e-139; confidence=high
Rice	`Os10g0440100` (Orysa) - identity=66.4; qcov=0.868; evalue=4.1e-131; confidence=high
GO	GO:0000977 (RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0005634 (nucleus); GO:0005667 (transcription regulator complex); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0051726 (regulation of cell cycle)
KEGG	smil03083 (Polycomb repressive complex - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02319 (WHD_E2F_TDP); PF08781 (DP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131002803

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057785254.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057785254.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057785254.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057785254.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057785254.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:62629761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:62630489`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr1:62633248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057785254.1

344 aa

172

344

WHD_E2F_TDP

PF02319 WHD_E2F_TDP 91-175 aa PF08781 DP 183-309 aa

XP_057785256.1

340 aa

170

340

WHD_E2F_TDP

PF02319 WHD_E2F_TDP 91-171 aa PF08781 DP 179-305 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057785254.1`	Pfam	`PF02319`	WHD_E2F_TDP	Domain	91	175	1.5e-19	70.2	E2F/DP family winged-helix DNA-binding domain
`XP_057785254.1`	Pfam	`PF08781`	DP	Domain	183	309	7.9e-34	117.2	Transcription factor DP
`XP_057785256.1`	Pfam	`PF02319`	WHD_E2F_TDP	Domain	91	171	1.1e-19	70.7	E2F/DP family winged-helix DNA-binding domain
`XP_057785256.1`	Pfam	`PF08781`	DP	Domain	179	305	8.1e-34	117.2	Transcription factor DP

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057929273.1
ATTAAATATGAAATTAGGAAATTCCAAATCTTTCTGAACTGTAATTTTTTGGGGAATTTACCGCGAAAGAATCTGAACATGATATATAAAGGATTTACCTTTTTGTTTGGTTTTTGACCCGCGCTATATTTACGTATTTATTATTGTGAGGAGTTCATGTGCTAGTTGTGTCTGTAGGCCGGATTGTTTCCTGGATTTCTCTAACAAATTTCGTGATATTTGGTAGCCTTTTACGATGTTTTGGTTGTATTTGAATTGAA...

XM_057929271.1
TGGTTTTTGACCCGCGCTATATTTACGTATTTATTATTGTGAGGAGTTCATGTGCTAGTTGTGTCTGTAGGCCGGATTGTTTCCTGGATTTCTCTAACAAATTTCGTGATATTTGGTAGCCTTTTACGATGTTTTGGTTGTATTTGAATTGAATTGTAAATAGGATCACTGAAATTCCCACCCTCGCGTTCATTCTGTTGGAATTCCCGTATTTGTCACCAGCCGTCAGGAGTAGGTATTTCTCTGTGTTTTTCGTGAGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131002803
ATGGTGAATCATAGCAGTGCTAATAATCATCAAGGAGGCCGTCGTGGTGTTGGAGGTGGAGGAGCCACCCGATCATGGGGCTCAACTGTTTCCGGCCAATCTATGTCGACTAGCGGCAGCGGGCCAGCTAGCGTGATTGAGGCTGCCGCGGCAACTCCGGCCACTGATAGCAAATTCAGTCGGTTAAACAATCTTGATGTCCAAGGCGATGATGCTGGCAATAGAAAGAAGAAGAGAGGTCAGAGTGCAGTCGCAGGTGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057785254.1
MVNHSSANNHQGGRRGVGGGGATRSWGSTVSGQSMSTSGSGPASVIEAAAATPATDSKFSRLNNLDVQGDDAGNRKKKRGQSAVAGDKSGRGLRQFSMKVCEKLESKGRTTYNEVADELVAEFAGPNNNLGSPDQNVFQQQYDEKNIRRRVYDALNVLMAMDIISKDKKEIQWKGLPHTSLSDIEELKTERAGHRSRVEKKGVYLMELEEQYVGLENLIHRNEKLYGSGNVPDRRVMLPFILVQTRPHATVEVEISEDFQ...

XP_057785256.1
MVNHSSANNHQGGRRGVGGGGATRSWGSTVSGQSMSTSGSGPASVIEAAAATPATDSKFSRLNNLDVQGDDAGNRKKKRGQSAVAGDKSGRGLRQFSMKVCEKLESKGRTTYNEVADELVAEFAGPNNNLGSPDQQQYDEKNIRRRVYDALNVLMAMDIISKDKKEIQWKGLPHTSLSDIEELKTERAGHRSRVEKKGVYLMELEEQYVGLENLIHRNEKLYGSGNVPDRRVMLPFILVQTRPHATVEVEISEDFQLVHF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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