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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004517`

染色体: Chr01 坐标: 63300428-63304872 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004517`
名称	SmilChr01G004517
描述	histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	63300428 - 63304872 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131003238`
GeneID	`131003238`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131003238`
原始查询	`LOC131003238`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH1-like
产物	histone-lysine N-methyltransferase%2C H3 lysine-9 specific SUVH1-like
Arabidopsis	`AT1G73100` (SUVH3) histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH3-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843641] identity=44.7; qcov=1.08; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os05g0490700` (OsSET22) - identity=42.1; qcov=1.07; evalue=1.19e-179; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0034968 (GO:0034968); GO:0042054 (histone methyltransferase activity)
KEGG	smil00310 (Lysine degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00856 (SET); PF02182 (SAD_SRA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131003238

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057785705.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057785705.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057785705.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057785705.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057785705.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:63301214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:63301284`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:63301524`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B56,B87,B96,C74
`Chr1:63301773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr1:63302058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr1:63302301`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C18
`Chr1:63302580`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	129	A1,A10,A11,A13,A14,A16,A19,A20,A3,A4,A8,B1,B100,B102,B104,B106,B107,B109,B11,B112,B113,B115,B118,B12,B120,B121,B122,B124,B125,B13,B131,B134,B137,B139,B140,B15,B16,B19,B21,B22,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B38,B4,B41,B46,B48,B50,B51,B53,B54,B58,B6,B61,B63,B64,B66,B68,B69,B70,B71,B74,B76,B90,B92,B98,B99,C1,C10,C12,C13,C16,C19,C20,C21,C22,C24,C25,C27,C29,C30,C31,C32,C36,C37,C39,C40,C41,C45,C47,C48,C49,C51,C55,C56,C6,C60,C61,C63,C64,C66,C68,C7,C70,C71,C76,C77,C84,C85,C86,C87,C9,D11,D3,D4,D5,D7,D8,D9
`Chr1:63302582`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	129	A1,A10,A11,A13,A14,A16,A19,A20,A3,A4,A8,B1,B100,B102,B104,B106,B107,B109,B11,B112,B113,B115,B118,B12,B120,B121,B122,B124,B125,B13,B131,B134,B137,B139,B140,B15,B16,B19,B21,B22,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B38,B4,B41,B46,B48,B50,B51,B53,B54,B58,B6,B61,B63,B64,B66,B68,B69,B70,B71,B74,B76,B90,B92,B98,B99,C1,C10,C12,C13,C16,C19,C20,C21,C22,C24,C25,C27,C29,C30,C31,C32,C36,C37,C39,C40,C41,C45,C47,C48,C49,C51,C55,C56,C6,C60,C61,C63,C64,C66,C68,C7,C70,C71,C76,C77,C84,C85,C86,C87,C9,D11,D3,D4,D5,D7,D8,D9
`Chr1:63302972`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,C38,C75
`Chr1:63302992`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr1:63303003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,B82
`Chr1:63303110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B25,B74,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057785705.1

681 aa

340

681

SAD_SRA

SET

PF02182 SAD_SRA 267-418 aa PF00856 SET 529-654 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057785705.1`	Pfam	`PF02182`	SAD_SRA	Domain	267	418	7.9e-55	185.4	SAD/SRA domain
`XP_057785705.1`	Pfam	`PF00856`	SET	Family	529	654	8.7e-21	75.1	SET domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057929722.1
TTTATTTATTTATTTGAGATACAAAAGCACTTTAAATTTACTCTTCCAACACAAATAACGCAGAAGCCTTCCTCAACCCAAGAGCCAAGAGGAAGCTGATGCTTTGCTGGTTTTGAATAAGCCATGTAATTGAAGCTGGTGTTGTTAATTTGCAGTAATAAATGGTGTTTGTATGTATAATGATGGATGTGCATTTTTTGGTTGTTGAGAGCAATTAGGAAATCATTGCTGCTGATAGCTTCTCAATATAAGTTAAGCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131003238
ATGGAGCAAGGTTTGGGATCTAATTCAAATGCTAATCCTGGGTCAATTGATAAGTCTAGGGTTTTAGATGTGAGGCCATTGAGAACCCTAGCCCCTGTTTTCCCAAATCCACCCGGTATGTCTTCAGTTGCAACCCCTCAACCCACGCCCTTTACATGTGTCCCGCCCTCTGGCCCGTTTCCTCCTGGAATCCAACCATTTTTCCCTTTTCTTGCTAGTGACACTCGGCAAGCCGGGCTGGGTGCACATAGTCAGTCTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057785705.1
MEQGLGSNSNANPGSIDKSRVLDVRPLRTLAPVFPNPPGMSSVATPQPTPFTCVPPSGPFPPGIQPFFPFLASDTRQAGLGAHSQSGNFGFGSSIPAPIPLNSFRTPTPQANGGSSQRKRASKARGRPPIVIEDDGYSDSQNQSDQYGSGFSTHDGDADVASNSRKRRGRPRRVAENGEGYESYDIESLVDSFMASFKLNNFDEFRNTNSDKDIVRTILLTFDLIRRRVAQLEEAKDASRGAARRPDLKAGALLMNKGVR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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