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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004478`

染色体: Chr01 坐标: 62878340-62884086 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004478`
名称	SmilChr01G004478
描述	uncharacterized SmilChr01G004478
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	62878340 - 62884086 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131003240`
GeneID	`131003240`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131003240`
原始查询	`LOC131003240`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA double-strand break repair protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834050]; symbol=AT5G40520; hit=AT5G40520; species=arabidopsis; confidence=low
产物	DNA double-strand break repair protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834050]; symbol=AT5G40520; hit=AT5G40520; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G40520` (AT5G40520) DNA double-strand break repair protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834050] identity=30.3; qcov=0.995; evalue=1.58e-57; confidence=low
Rice	`Os09g0103200` - identity=23.6; qcov=0.744; evalue=1.24e-15; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131003240

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057785717.1`
2	Chromosome	染色体	0.60000	`XP_057785717.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057785754.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057785717.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057785717.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:62879472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,C85
`Chr1:62879512`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A7,B3,B49,C3
`Chr1:62879561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr1:62879623`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:62879897`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,C33,C60
`Chr1:62879898`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C85
`Chr1:62879898`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C85
`Chr1:62879916`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr1:62879940`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,C85
`Chr1:62879951`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	81	A11,A2,A20,A24,A5,A6,B101,B103,B105,B106,B119,B13,B135,B138,B139,B15,B17,B21,B22,B26,B29,B33,B36,B39,B4,B40,B45,B47,B48,B49,B52,B56,B57,B59,B60,B61,B62,B72,B76,B85,B88,B9,B90,B92,B94,B96,C1,C10,C12,C21,C22,C24,C25,C27,C29,C31,C33,C37,C38,C40,C49,C5,C50,C51,C54,C55,C56,C60,C63,C64,C66,C70,C71,C73,C74,C77,C8,C86,D1,D11,D4
`Chr1:62879977`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	A23,A7,B111,B121,B42,B43,B60,B67,B72,B78,B99,C16,C27,C5,C6,C7,C70
`Chr1:62879981`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	17	A23,A7,B111,B121,B42,B43,B60,B67,B72,B78,B99,C16,C27,C5,C6,C7,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA

XM_057929751.1
AGGTCTCAAACTCTCAAATCTCAATTCTCGTCTGAATTTGAAAATTGGATCTGCACGCAGCGTCGCAGCCGCTTCACGCACACCTCAATTCCTCCGCCGCCGCTGCTCGCCTCCGCCGCCTCGCTGCTGATTGTTGTCGCGCTCTCCGGAATTCGCTGCTCTCCGCCGCTCCGGGAGTTCCTGCCCTCTCCGCCGCACGCCGCCGCGCCGGGAGTTCCTACGCTCTCCGCCGCACGCCGCCGCCGCGCCGCGAAGCTGCT...

XM_057929734.1
AGGTCTCAAACTCTCAAATCTCAATTCTCGTCTGAATTTGAAAATTGGATCTGCACGCAGCGTCGCAGCCGCTTCACGCACACCTCAATTCCTCCGCCGCCGCTGCTCGCCTCCGCCGCCTCGCTGCTGATTGTTGTCGCGCTCTCCGGAATTCGCTGCTCTCCGCCGCTCCGGGAGTTCCTGCCCTCTCCGCCGCACGCCGCCGCGCCGGGAGTTCCTACGCTCTCCGCCGCACGCCGCCGCCGCGCCGCGAAGCTGCT...

CDS

6 records

下载 CDS FASTA

LOC131003240
ATGGATGAGGATTTTGTGGCAGTACTAAACCAGGAATGGCATAGAACAGATTTGAAAGCACTAACAAAGAAAATTCGGGAGCATGAATCTACAATGAGGCTCAAGCGCAGGTGGTTGATGGATCTACCTTTGTCCAAACAGGAACAAAAGAGGATTGAGGAATTACTGCCTCCCAATGATATGATATTGCCCGAGTCTTTCCTTAGAGAAGATGATGTTGGCCATGAGGACATCAGGACTTGTATTGAGAAGGCATTTGG...

Protein

6 records

下载 Protein FASTA

XP_057785717.1
MDEDFVAVLNQEWHRTDLKALTKKIREHESTMRLKRRWLMDLPLSKQEQKRIEELLPPNDMILPESFLREDDVGHEDIRTCIEKAFGAPNSQEDPISEMPFGASNSQEEPICDRADVTVFNSSDSFQEVSFLLDAMTNKGICSFVRILTGGLDIFDKTKWGMMRTIKELLPKVIADKNEVSRTKLKRCSLILRDPTNFWGNETMRFTASESYCAAAFKVLERLEDFSSRTIHAMLRKLKSVKGYIPSLQTPRIRHLGRLI...

XP_057785725.1
MDEDFVAVLNQEWHRTDLKALTKKIREHESTMRLKRRWLMDLPLSKQEQKRIEELLPPNDMILPESFLREDDVGHEDIRTCIEKAFGAPNSQEDPISEMPFGASNSQEEPICDRADVTVFNSSDSFQEVSFLLDAMTNKGICSFVRILTGGLDIFDKTKWGMMRTIKELLPKVIADKNEVSRTKLKRCSLILRDPTNFWGNETMRFTASESYCAAAFKVLERLEDFSSRTIHAMLRKLKSVKGYIPSLQTPRIRHLGRLI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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