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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004502`

染色体: Chr01 坐标: 63125172-63128579 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004502`
名称	SmilChr01G004502
描述	phosphatidylinositol 4-kinase gamma 8-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	63125172 - 63128579 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131003297`
GeneID	`131003297`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131003297`
原始查询	`LOC131003297`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphatidylinositol 4-kinase gamma 8-like
产物	phosphatidylinositol 4-kinase gamma 8-like
Arabidopsis	`AT2G40850` (PI4K GAMMA 1) phosphoinositide 4-kinase gamma 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818683] identity=42.6; qcov=1.1; evalue=6.72e-137; confidence=medium
Rice	`Os06g0283400` - identity=37.4; qcov=1.08; evalue=1.22e-105; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00454 (PI3_PI4_kinase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131003297

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057785788.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057785788.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057785788.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057785788.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057785788.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:63125646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,C15
`Chr1:63126162`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B140,B74,C2,C48
`Chr1:63126897`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:63127086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057785788.1

567 aa

284

567

PI3_PI4_kinase

PF00454 PI3_PI4_kinase 117-349 aa

XP_057785798.1

533 aa

266

533

PI3_PI4_kinase

PF00454 PI3_PI4_kinase 117-321 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057785788.1`	Pfam	`PF00454`	PI3_PI4_kinase	Family	117	349	3.2e-43	149.1	Phosphatidylinositol 3- and 4-kinase
`XP_057785798.1`	Pfam	`PF00454`	PI3_PI4_kinase	Family	117	321	1.4e-38	133.9	Phosphatidylinositol 3- and 4-kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057929815.1
AAACCGTCGCGCGGGAACATCGGAGCTCGAGAGAATATCTGCGTTTACCAGTTTTTTTTTGTTTTTTCTTTTTTTCTGAGGAAAAAAAGGGGTGGGTTATATATAAATGAAAAAAATAAACAAATGAAAAATTCCTGCATGAAAACGTAAAAAAAAAAAAAGTCGTAATTTCCGGTAGGAAGGTTTTTTTCGGTGACGGAATAATCCGCTCTCGCGCTCTCCCGTTGCCGTTGCCGTTGCCGTTGCATCACCCTGAATAC...

XM_057929805.1
AACCGTCGCGCGGGAACATCGGAGCTCGAGAGAATATCTGCGTTTACCAGTTTTTTTTTGTTTTTTCTTTTTTTCTGAGGAAAAAAAGGGGTGGGTTATATATAAATGAAAAAAATAAACAAATGAAAAATTCCTGCATGAAAACGTAAAAAAAAAAAAAGTCGTAATTTCCGGTAGGAAGGTTTTTTTCGGTGACGGAATAATCCGCTCTCGCGCTCTCCCGTTGCCGTTGCCGTTGCCGTTGCATCACCCTGAATACC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131003297
ATGGCTGTCGCCGTTGATCATGGTCATGGATTCAAGCCATTTACAAGACCCCCACGATGCAGACTCCAGTCCTTCACTCAACTTGACTACAAGATGCTCGACAAGCTCGACCAATCTTTGGAACATGACTGCGAGTTGTCTAACATCCACAAGAGCTTCTCCACTCCGTGCCTATCCAATTCCTCGTCAGTGAGAGACGACCGTGATACCAATTCAAGGATTGAGATCATCATCGGCCATGCTGCACCAAGGGTACGAGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057785788.1
MAVAVDHGHGFKPFTRPPRCRLQSFTQLDYKMLDKLDQSLEHDCELSNIHKSFSTPCLSNSSSVRDDRDTNSRIEIIIGHAAPRVRAMVVEVAIAMASGVKPEPTSSGLGGAYFLRSQNGDTIAVAKPIDEEPLAFNNPKGLAGRLLGQPGMKCSIRIGETGLRESAAYVLDHDGFAGVPPTALVRFSHVKFNINNPGSDSTTIYKIASLQRYVKHDSDAGDLGPSSFSVTCVHHIGILDVRLMNLDRHAGNILVRHGQD...

XP_057785798.1
MAVAVDHGHGFKPFTRPPRCRLQSFTQLDYKMLDKLDQSLEHDCELSNIHKSFSTPCLSNSSSVRDDRDTNSRIEIIIGHAAPRVRAMVVEVAIAMASGVKPEPTSSGLGGAYFLRSQNGDTIAVAKPIDEEPLAFNNPKGLAGRLLGQPGMKCSIRIGETGLRESAAYVLDHDGFAGVPPTALVRFSHVKFNINNPGSDSTTIYKIASLQRYVKHDSDAGDLGPSSFSVTCVHHIGILDVRLMNLDRHAGNILVRHGQD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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