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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004532`

染色体: Chr01 坐标: 63493513-63495224 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004532`
名称	SmilChr01G004532
描述	presenilin-like protein At1g08700
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	63493513 - 63495224 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131003519`
GeneID	`131003519`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131003519`
原始查询	`LOC131003519`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	presenilin-like protein At1g08700
产物	presenilin-like protein At1g08700
Arabidopsis	`AT1G08700` (PS1) Presenilin-1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837391] identity=55; qcov=1.07; evalue=2.54e-162; confidence=high
Rice	`Os01g0276400` - identity=52.2; qcov=0.927; evalue=2.13e-129; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0016020 (membrane); GO:0016485 (protein processing); GO:0042500 (aspartic endopeptidase activity, intramembrane cleaving)
KEGG	smil04519 (Cadherin signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01080 (Presenilin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131003519

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057786014.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057786014.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057786014.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057786014.1`
5	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057786014.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:63493804`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr1:63493920`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C1
`Chr1:63493920`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C1
`Chr1:63493950`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B122,B125,B15,B34,C24,C72
`Chr1:63493951`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B122,B125,B34,C24
`Chr1:63493951`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B122,B125,B34,C24
`Chr1:63493991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C1
`Chr1:63493991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr1:63494053`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr1:63494326`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr1:63494342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr1:63494362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057786014.1

438 aa

219

438

Presenilin

PF01080 Presenilin 10-428 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057786014.1`	Pfam	`PF01080`	Presenilin	Family	10	428	6.9e-123	411.2	Presenilin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057930031.1
TAAGCAAAGTGAGCTTTCCCAATATGTGTGATCTATATTTTCAACAGTAATAAATACCGCAGTTGTGTACTAGTCTTCGTTCCTACCCCCTGAGACAAAAAAGCTCCAAAACCTCTGATTTTTTTTAATTTAATCCGCTACAGATTTCCCCTCCAATCCGCCCCCAATTCGACCGCTCCCTCACCGATCCCGCCGCCGCTCTCCCCGTCGCCGATAACGGACAGCGGAAATGGAGAGTGGAAGCGTTCTGGAAACCATCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131003519
ATGGAGAGTGGAAGCGTTCTGGAAACCATCGGCCAAGAGATAATCGGCGTGATGGCGCCTGTCTCCGTCTGCATGCTTCTCGTCGTCCTCCTCGTCTACACTGTCTACAACCCCTCCTCCTCCGCCGCCGCCACCACCATCCGCACCGCCGCCAATTTGGTCTACATGGAGTCCCCGACCGATTCCACCGCGCAGAAGCTCGAGGGAGCCATCCTCAACGCCGTTGTTTTCATCGTCATCATAACTCTAGTCACCTTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057786014.1
MESGSVLETIGQEIIGVMAPVSVCMLLVVLLVYTVYNPSSSAAATTIRTAANLVYMESPTDSTAQKLEGAILNAVVFIVIITLVTFLLVLLYYYRFNNFLLYYTRFSVFLIFSAMGSSILISIVQRFNIPIDAATFYVLLFNFTVLGTISVFSDGIPIIVKQSTMVVLGIIVAAWFSRLPEWTTWIVLVALALYDLAAVLAPGGPLKLLVELASSREEELPALVYECRPNVGRNSGARVSNLGFLVAAGVGMSSDNNTSN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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