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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004534`

染色体: Chr01 坐标: 63507936-63510819 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004534`
名称	SmilChr01G004534
描述	uncharacterized SmilChr01G004534
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	63507936 - 63510819 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131003706`
GeneID	`131003706`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131003706`
原始查询	`LOC131003706`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Co-chaperone GrpE family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831638]; symbol=EMB1241; hit=AT5G17710; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Co-chaperone GrpE family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831638]; symbol=EMB1241; hit=AT5G17710; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G17710` (EMB1241) Co-chaperone GrpE family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831638] identity=66.7; qcov=0.571; evalue=3.49e-70; confidence=medium
Rice	`Os02g0612000` - identity=59.7; qcov=0.584; evalue=3.08e-67; confidence=medium
GO	GO:0000774 (adenyl-nucleotide exchange factor activity); GO:0006457 (protein folding); GO:0009507 (chloroplast); GO:0042803 (protein homodimerization activity); GO:0051082 (GO:0051082); GO:0051087 (protein-folding chaperone binding)
KEGG	-
Pfam	PF01025 (GrpE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131003706

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057786238.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057786238.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057786238.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057786238.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057786238.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:63508079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr1:63509132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B21,C16,C7
`Chr1:63509133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B21,C16,C7
`Chr1:63509352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B98
`Chr1:63509526`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr1:63510478`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:63510495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B24,B50,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057786238.1

353 aa

176

353

GrpE

PF01025 GrpE 162-317 aa

XP_057786242.1

310 aa

155

310

GrpE

PF01025 GrpE 162-281 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057786238.1`	Pfam	`PF01025`	GrpE	Family	162	317	2.4e-42	145.1	GrpE
`XP_057786242.1`	Pfam	`PF01025`	GrpE	Family	162	281	1e-23	84.6	GrpE

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057930259.1
TTGGTAGATTCTAGACTGCAGTGGAGCTGTAGCGACTAAACCCTCAAATTCAATCCTCTTTTATTCCTCCAGCCATTTATCCTCTCCTGTCCTCAACTACTCTCGCTCTCTCTCTGCAATGGCCACAGCAATGTTAAAAACGCCACCAACCTTCTGTACGCCGGCGGCCTATCTTTGCAGTACCGCCGCCGGCGGTTCCTCCGTCAAACCTCACAATATCCCTCGCATTTCCTTTACATCCAGTAGGATCCCACTGCCTT...

XM_057930255.1
TGCAATGGCCACAGCAATGTTAAAAACGCCACCAACCTTCTGTACGCCGGCGGCCTATCTTTGCAGTACCGCCGCCGGCGGTTCCTCCGTCAAACCTCACAATATCCCTCGCATTTCCTTTACATCCAGTAGGATCCCACTGCCTTTGATACGGTGTCGGATTCACCACTCCAGACACAAGAAGAGTGGCGTCAAATTTCCCAGCCGCTCCGCTCAGAAATTCTCGACCTACGCTGCTAATGGAGAAACCGCGGAGGCCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131003706
ATGGCCACAGCAATGTTAAAAACGCCACCAACCTTCTGTACGCCGGCGGCCTATCTTTGCAGTACCGCCGCCGGCGGTTCCTCCGTCAAACCTCACAATATCCCTCGCATTTCCTTTACATCCAGTAGGATCCCACTGCCTTTGATACGGTGTCGGATTCACCACTCCAGACACAAGAAGAGTGGCGTCAAATTTCCCAGCCGCTCCGCTCAGAAATTCTCGACCTACGCTGCTAATGGAGAAACCGCGGAGGCCGAAAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057786238.1
MATAMLKTPPTFCTPAAYLCSTAAGGSSVKPHNIPRISFTSSRIPLPLIRCRIHHSRHKKSGVKFPSRSAQKFSTYAANGETAEAETEIQEKEPAQGSDSGPEIEGDTDGATDVDGSSETNDAIADEPNSVVIASLKVYKEALANNDDSKAAEVESFLKSIEDDKNDLERKVATLSEELQYEKDRVLRISADFDNFRKRTERDRLSQVSNARGEVLENLLPVLDNFERAKAQIKVETEGEEKINNSYQSIYKQFVEILVS...

XP_057786242.1
MATAMLKTPPTFCTPAAYLCSTAAGGSSVKPHNIPRISFTSSRIPLPLIRCRIHHSRHKKSGVKFPSRSAQKFSTYAANGETAEAETEIQEKEPAQGSDSGPEIEGDTDGATDVDGSSETNDAIADEPNSVVIASLKVYKEALANNDDSKAAEVESFLKSIEDDKNDLERKVATLSEELQYEKDRVLRISADFDNFRKRTERDRLSQVSNARGEVLENLLPVLDNFERAKAQIKVETEGEEKINNSYQSIYKQFVEILVS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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