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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004521`

染色体: Chr01 坐标: 63319523-63321009 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004521`
名称	SmilChr01G004521
描述	probable aquaporin SIP2-1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	63319523 - 63321009 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131003831`
GeneID	`131003831`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131003831`
原始查询	`LOC131003831`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable aquaporin SIP2-1
产物	probable aquaporin SIP2-1
Arabidopsis	`AT3G56950` (SIP2;1) small and basic intrinsic protein 2;1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824862] identity=50.4; qcov=0.951; evalue=3.71e-80; confidence=high
Rice	`Os03g0320000` (OsSIP1) - identity=41.1; qcov=0.967; evalue=2.11e-55; confidence=medium
GO	GO:0015267 (channel activity); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00230 (MIP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131003831

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057786368.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057786368.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057786372.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057786368.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057786368.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:63319781`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr1:63319845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057786372.1

244 aa

122

244

MIP

PF00230 MIP 8-214 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057786372.1`	Pfam	`PF00230`	MIP	Family	8	214	3.8e-06	27.6	Major intrinsic protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057930389.1
ATGGCGGGCGCACGGCGGCTGCTCGCGGCGGATTTCGCGATTTCGCTAACGTGGGTGTTCTCGAACGAGCTAATCAAGATTTTCGTGCAGAGCGTGATGGGTAACGCCGCTAGTCAGCTGGAGGGCGACATTGCTAGATGTGCCCTCGCCGTTGTCAACATGTTCGCCTTCGCCTACATGAGCAAGGCCACCGACGGCGGCGCGTACAATCCACTCTCCGTCTTGGCCCCCGCCATTTCGGGAGATTTCTCGAATTTCAT...

XM_057930385.1
ATGGCGGGCGCACGGCGGCTGCTCGCGGCGGATTTCGCGATTTCGCTAACGTGGGTGTTCTCGAACGAGCTAATCAAGATTTTCGTGCAGAGCGTGATGGGTAACGCCGCTAGTCAGCTGGAGGGCGACATTGCTAGATGTGCCCTCGCCGTTGTCAACATGTTCGCCTTCGCCTACATGAGCAAGGCCACCGACGGCGGCGCGTACAATCCACTCTCCGTCTTGGCCCCCGCCATTTCGGGAGATTTCTCGAATTTCAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131003831
ATGGCGGGCGCACGGCGGCTGCTCGCGGCGGATTTCGCGATTTCGCTAACGTGGGTGTTCTCGAACGAGCTAATCAAGATTTTCGTGCAGAGCGTGATGGGTAACGCCGCTAGTCAGCTGGAGGGCGACATTGCTAGATGTGCCCTCGCCGTTGTCAACATGTTCGCCTTCGCCTACATGAGCAAGGCCACCGACGGCGGCGCGTACAATCCACTCTCCGTCTTGGCCCCCGCCATTTCGGGAGATTTCTCGAATTTCAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057786368.1
MAGARRLLAADFAISLTWVFSNELIKIFVQSVMGNAASQLEGDIARCALAVVNMFAFAYMSKATDGGAYNPLSVLAPAISGDFSNFIFTVGARIPAQVVGSVYGVRLILWTFPGIGHAPHLKVDIATGALTEGLLAFAIVTITLGLATQDFLTKTWISSLAKLTLHILAADLTGGCMNPAPVSISFLLRLISPPLKSLSSSQVMGWAFANRQHITKEHLIVYCLAPVEATLLAVWLSGILFRMKKDERSAVKKATSPQQK...

XP_057786372.1
MAGARRLLAADFAISLTWVFSNELIKIFVQSVMGNAASQLEGDIARCALAVVNMFAFAYMSKATDGGAYNPLSVLAPAISGDFSNFIFTVGARIPAQVVGSVYGVRLILWTFPGIGHAPHLKVDIATGALTEGLLAFAIVTITLGLATQDFLTKTWISSLAKLTLHILAADLTGGCMNPAPVMGWAFANRQHITKEHLIVYCLAPVEATLLAVWLSGILFRMKKDERSAVKKATSPQQKLEKSD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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