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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004500`

染色体: Chr01 坐标: 63097059-63098125 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004500`
名称	SmilChr01G004500
描述	3'-5' exonuclease-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	63097059 - 63098125 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131003912`
GeneID	`131003912`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131003912`
原始查询	`LOC131003912`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	3'-5' exonuclease-like
产物	3'-5' exonuclease-like
Arabidopsis	`AT3G12460` (AT3G12460) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820425] identity=31.9; qcov=0.991; evalue=2.37e-27; confidence=low
Rice	`Os01g0660800` - identity=49; qcov=0.917; evalue=1.07e-58; confidence=high
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006139 (nucleobase-containing compound metabolic process); GO:0008408 (3'-5' exonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF01612 (DNA_pol_A_exo1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131003912

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057786468.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057786468.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057786468.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057786468.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057786468.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:63097331`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B48
`Chr1:63097331`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B48
`Chr1:63097807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B31,B47,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057786468.1

218 aa

109

218

DNA_pol_A_exo1

PF01612 DNA_pol_A_exo1 55-207 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057786468.1`	Pfam	`PF01612`	DNA_pol_A_exo1	Domain	55	207	1.1e-13	52.1	3'-5' exonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057930485.1
AAATTCGAGCTAAATATAAAACTAATAAAAAAAGAAATGAAATTAATTACAACCGCGTACGAAATTCAATATAAAAGAATATTCAAGATTTTTTACATACGAAATTCCTGACAAAATATCAATGAAAATCTCGACTCAGAACCTCAACCCTAGGAGTATAAAGTAGACCCTCATTTCTAAATTCTCACCATTCCAAAACCCCCAAAACTCAAAAAGCTCCATCACTCCAACAATGGCGATCAGCATCACGGCAAACACCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131003912
ATGGCGATCAGCATCACGGCAAACACCATGCGCGTTAGCACACACCAAACCTACAACGTCAACTTCTTCGAGGAGGAAATCTACACCACCGTAACCGACAACCCCGCCGTCGTCACCGGCTGGATCGACGACATCAAGTACCTCCACCGCCTGCCCGGCCTCATCGTCGGCCTCGACGTCGAGTGGCGCCCCAGCTACTCCACTCAACGCAACCCCGTCGCCACGCTGCAGCTCTGCGTGCGCGACCGCTGCCTCGTCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057786468.1
MAISITANTMRVSTHQTYNVNFFEEEIYTTVTDNPAVVTGWIDDIKYLHRLPGLIVGLDVEWRPSYSTQRNPVATLQLCVRDRCLVYQIFQTDRIPESLAEFLSTEFRFISFVGVNIKEDLEKLQSDYGIGGGARYVDLRGLAADAYGMEELERAGLKTLASVVLGKEVEKPREVTMSRWDARRLSVEQVKYACVDAYLSFEIGRALGLGDFDNYGFY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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