当前解析结果
SmilChr01G004506| 统一新 Gene ID | SmilChr01G004506 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G004506 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G004506 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 63167386 - 63168771 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131004000 |
|---|---|
| GeneID | 131004000 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131004000 |
| 原始查询 | LOC131004000 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131004000 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057786558.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057786558.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057786558.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057786558.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057786558.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:63168193 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 4 | A24,B33,C86,C87 |
Chr1:63168193 |
T |
TA |
1bp_insertion | CDS_variant | 4 | A24,B33,C86,C87 |
Chr1:63168228 |
TTC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B33,C86,C87 |
Chr1:63168228 |
TTC |
T |
2bp_deletion | CDS_variant | 3 | B33,C86,C87 |
Chr1:63168425 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B84 |
Chr1:63168437 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 129 | A10,A11,A15,A16,A18,A19,A20,A21,A24,A25,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B10,B100,B101,B102,B105,B108,B109,B11,B111,B112,B119,B12,B120,B124,B127,B129,B13,B130,B133,B136,B137,B138,B140,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B22,B23,B24,B28,B35,B37,B38,B39,B40,B43,B45,B46,B5,B52,B53,B54,B55,B57,B58,B6,B60,B67,B7,B70,B72,B75,B77,B79,B8,B80,B86,B89,B9,B91,B93,B94,B95,B97,B98,B99,C1,C11,C14,C15,C16,C20,C24,C26,C27,C28,C3,C30,C31,C33,C34,C35,C37,C39,C4,C42,C43,C45,C46,C51,C54,C56,C57,C58,C61,C64,C66,C67,C69,C73,C78,C8,C81,C83,C84,C85,C87,D1,D11,D8 |
Chr1:63168439 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 131 | A10,A11,A15,A16,A18,A19,A20,A21,A24,A25,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B10,B100,B101,B102,B105,B108,B109,B11,B111,B112,B119,B12,B120,B124,B127,B129,B13,B130,B133,B136,B137,B138,B140,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B22,B23,B24,B28,B35,B37,B38,B39,B40,B43,B45,B46,B5,B52,B53,B54,B55,B57,B58,B6,B60,B67,B7,B70,B72,B75,B77,B79,B8,B80,B84,B86,B89,B9,B91,B93,B94,B95,B97,B98,B99,C1,C11,C14,C15,C16,C20,C24,C26,C27,C28,C3,C30,C31,C33,C34,C35,C37,C39,C4,C42,C43,C45,C46,C51,C54,C56,C57,C58,C61,C64,C66,C67,C69,C73,C78,C8,C81,C83,C84,C85,C87,C9,D1,D11,D8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。