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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001208`

染色体: Chr01 坐标: 24300473-24301747 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001208`
名称	SmilChr01G001208
描述	uncharacterized SmilChr01G001208
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	24300473 - 24301747 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131004005`
GeneID	`131004005`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131004005`
原始查询	`LOC131004005`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hAT dimerization domain-containing protein / transposase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833333]; symbol=AT5G33406; hit=AT5G33406; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	hAT dimerization domain-containing protein / transposase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833333]; symbol=AT5G33406; hit=AT5G33406; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G33406` (AT5G33406) hAT dimerization domain-containing protein / transposase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833333] identity=43.3; qcov=0.991; evalue=4.06e-87; confidence=medium
Rice	`Os09g0499600` - identity=40.3; qcov=0.868; evalue=2.87e-58; confidence=medium
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF05699 (Dimer_Tnp_hAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131004005

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057786587.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057786587.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057786587.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057786587.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057786587.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:24300493`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B110,B40,B50,C50,D11
`Chr1:24300493`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B40,B50,C50,D11
`Chr1:24300508`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,B76
`Chr1:24300545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B40,B50,C50,D11
`Chr1:24300553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C32,C68,D4
`Chr1:24300575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,D6
`Chr1:24300608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	C32,C68,D4
`Chr1:24300608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C32,C68,D4
`Chr1:24300644`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,B76
`Chr1:24300677`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B24,C8,C85,C86
`Chr1:24300717`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,B76
`Chr1:24300719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	93	A11,A15,A18,A19,A2,A21,A24,A25,A4,A9,B103,B108,B109,B11,B113,B117,B118,B121,B122,B125,B130,B132,B134,B136,B137,B138,B17,B21,B25,B27,B28,B31,B32,B33,B34,B37,B42,B43,B48,B5,B52,B53,B56,B62,B65,B66,B68,B69,B70,B71,B72,B78,B8,B82,B83,B84,B87,B90,B92,B93,B94,B96,C19,C2,C20,C25,C26,C27,C28,C30,C35,C38,C4,C41,C42,C45,C46,C5,C61,C62,C66,C75,C76,C79,C80,C82,D10,D11,D3,D4,D5,D6,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057786587.1

340 aa

170

340

Dimer_Tnp_hAT

PF05699 Dimer_Tnp_hAT 166-225 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057786587.1`	Pfam	`PF05699`	Dimer_Tnp_hAT	Domain	166	225	3.1e-10	40.4	hAT family C-terminal dimerisation region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057930604.1
ATGTTCACTTCTGAAGAATGGACACAAAATAAGTTGTTTAAGGAAGCTAAGGGGAAGCATGCAACAAAAATTGCACTCCTGCCTTTGTTTTGGAATAATATTGTGTACACTCTCAAAGTCATGGCTCCTCTTGTACGAGTCCTTCGACTTGTTGATGGTGAAAAGAAACCGGCAATGGGGTACATTTATGAAGCAATGGAGAAGGCAAAAGAAGAAATAACAAAGTCTTCTCAAAACAATGAAAGTCGATACAAAGAAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131004005
ATGTTCACTTCTGAAGAATGGACACAAAATAAGTTGTTTAAGGAAGCTAAGGGGAAGCATGCAACAAAAATTGCACTCCTGCCTTTGTTTTGGAATAATATTGTGTACACTCTCAAAGTCATGGCTCCTCTTGTACGAGTCCTTCGACTTGTTGATGGTGAAAAGAAACCGGCAATGGGGTACATTTATGAAGCAATGGAGAAGGCAAAAGAAGAAATAACAAAGTCTTCTCAAAACAATGAAAGTCGATACAAAGAAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057786587.1
MFTSEEWTQNKLFKEAKGKHATKIALLPLFWNNIVYTLKVMAPLVRVLRLVDGEKKPAMGYIYEAMEKAKEEITKSSQNNESRYKEVFTIIDNRWNCQLHRPLHAASHFLNPDTLYENKQLKFDMEATRGLYDTIRRLVPSKDAQDKILEEMESYKSRGGLFGSDLAERQRKKIAPAQWWRMYGHSTPNLQQLAIKILGLTCSASECERNWSYNQKLVDRHNRRHEIDPISLNDIDECNEWLAGEVDDENDEENDLVFDD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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