当前解析结果
SmilChr01G004556| 统一新 Gene ID | SmilChr01G004556 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G004556 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G004556 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 63651415 - 63652425 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131004121 |
|---|---|
| GeneID | 131004121 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131004121 |
| 原始查询 | LOC131004121 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131004121 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057786714.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.60000 | XP_057786714.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057786714.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057786714.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057786714.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:63651535 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B118,C33,C5 |
Chr1:63651546 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B4,C36,D6 |
Chr1:63651582 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 6 | A1,B33,B52,B53,B99,C31 |
Chr1:63651589 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D3 |
Chr1:63651597 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 26 | A14,A22,A25,A9,B123,B127,B13,B131,B28,B35,B40,B47,B51,B57,B76,B79,B83,B93,C18,C19,C27,C59,C62,C65,C8,C80 |
Chr1:63651618 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B140,C79 |
Chr1:63651636 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C15,C70,C82 |
Chr1:63651646 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B122,B24,B53,B94,C71 |
Chr1:63651662 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B53,C15 |
Chr1:63651667 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B122,B94 |
Chr1:63651678 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B118,B46,B53,B77,C85 |
Chr1:63651692 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B99 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。