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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004558`

染色体: Chr01 坐标: 63670918-63672419 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004558`
名称	SmilChr01G004558
描述	uncharacterized SmilChr01G004558
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	63670918 - 63672419 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131004149`
GeneID	`131004149`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131004149`
原始查询	`LOC131004149`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DUF309 domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818711]; symbol=AT2G41120; hit=AT2G41120; species=arabidopsis; confidence=high
产物	DUF309 domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818711]; symbol=AT2G41120; hit=AT2G41120; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G41120` (AT2G41120) DUF309 domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818711] identity=56.8; qcov=0.909; evalue=5.46e-87; confidence=high
Rice	`Os11g0130200` - identity=52.5; qcov=0.731; evalue=2.13e-61; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03745 (DUF309)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131004149

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057786754.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057786754.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057786754.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057786754.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057786754.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:63671890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057786754.1

253 aa

126

253

DUF309

PF03745 DUF309 66-122 aa

XP_057786762.1

242 aa

121

242

DUF309

PF03745 DUF309 66-122 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057786754.1`	Pfam	`PF03745`	DUF309	Family	66	122	5.1e-23	81.2	Domain of unknown function (DUF309)
`XP_057786762.1`	Pfam	`PF03745`	DUF309	Family	66	122	4.1e-23	81.6	Domain of unknown function (DUF309)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057930779.1
ATGTATTCTACATTAACAAAAAATTTAAACAGTAGATAATCCATCATCATCTGAGAAACGATGTGATCAAAATTACGTTGGCAAAAATTGAATAAGAAAAATAAATGAAAATAGATGGTTGGATAAAAATGAGAAATTAGTAGGATATTTTAGTTGAGAAAATGAAGGGTCTAGCAGAAAGCAGGATCCCTTGCAAAAATGGCTGCTCTCATATCTTGTCTCCCAGGGCCAGCATCAACAACTCATCCAGCGTCACTCAA...

XM_057930771.1
TTTAAACAGTAGATAATCCATCATCATCTGAGAAACGATGTGATCAAAATTACGTTGGCAAAAATTGAATAAGAAAAATAAATGAAAATAGATGGTTGGATAAAAATGAGAAATTAGTAGGATATTTTAGTTGAGAAAATGAAGGGTCTAGCAGAAAGCAGGATCCCTTGCAAAAATGGCTGCTCTCATATCTTGTCTCCCAGGGCCAGCATCAACAACTCATCCAGCGTCACTCAAAAAATCATTGAAAACCAAAACTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131004149
ATGGCTGCTCTCATATCTTGTCTCCCAGGGCCAGCATCAACAACTCATCCAGCGTCACTCAAAAAATCATTGAAAACCAAAACTTTCTTCACCACTTGTTCTCCACCGTTTTCCAATCGAGGAATCGTAAAGGTAAGGAATTCGTACCGGATGAGCAGCCGCGGCATCACCCACGACGACGAAGAAATCTGCAGCTTCGACGAGGCAGTCTCGCTTTTCAACACAAGGGATTACTACAAATGCCACGACGTTCTCGAAGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057786754.1
MAALISCLPGPASTTHPASLKKSLKTKTFFTTCSPPFSNRGIVKVRNSYRMSSRGITHDDEEICSFDEAVSLFNTRDYYKCHDVLEALWNNSQDPTRTLLHGILQCAVGFHHLFNHNHKGAMMELGEGLCKLRKMNFQNGPFHQFERDISAVLEFIYQTQLEQAACQYLSLSLSFLPIFVISFIHFKNPSRHRTSLCCNGSIREVVPASRGLCRRRASLPPRNRPELERLHRFLTGKVSPNSSSTAEYKDTTA

XP_057786762.1
MAALISCLPGPASTTHPASLKKSLKTKTFFTTCSPPFSNRGIVKVRNSYRMSSRGITHDDEEICSFDEAVSLFNTRDYYKCHDVLEALWNNSQDPTRTLLHGILQCAVGFHHLFNHNHKGAMMELGEGLCKLRKMNFQNGPFHQFERDISAVLEFIYQTQLEQAACTEQVCVAMDQSERSYQLLGGYAAGERLYHLEIDRSWNAYIVFLPEKYRQTAAAPPSIKIPLLEASEQHVMELDLPY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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