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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004584`

染色体: Chr01 坐标: 63876407-63878180 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004584`
名称	SmilChr01G004584
描述	RING-H2 finger protein ATL43-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	63876407 - 63878180 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131004487`
GeneID	`131004487`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131004487`
原始查询	`LOC131004487`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING-H2 finger protein ATL43-like
产物	RING-H2 finger protein ATL43-like
Arabidopsis	`AT5G05810` (ATL43) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830466] identity=49.9; qcov=0.927; evalue=1.23e-89; confidence=high
Rice	`Os06g0695900` - identity=40.4; qcov=0.932; evalue=3.67e-63; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF12678 (zf-rbx1); PF12861 (zf-ANAPC11); PF13639 (zf-RING_2); PF13923 (zf-C3HC4_2); PF17123 (zf-RING_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131004487

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057787169.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787169.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787169.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057787169.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057787169.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:63876862`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,D5
`Chr1:63876898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:63876908`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:63877072`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr1:63877123`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,D11
`Chr1:63877312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787169.1

385 aa

192

385

zf-RING_11

zf-C3HC4_2

zf-RING_2

zf-C3HC4

zf-rbx1

zf-ANAPC11

PF17123 zf-RING_11 118-147 aa PF13923 zf-C3HC4_2 118-160 aa PF13639 zf-RING_2 118-161 aa PF00097 zf-C3HC4 119-160 aa PF12678 zf-rbx1 124-161 aa PF12861 zf-ANAPC11 125-162 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787169.1`	Pfam	`PF17123`	zf-RING_11	Domain	118	147	4.1e-10	39.9	RING-like zinc finger
`XP_057787169.1`	Pfam	`PF13923`	zf-C3HC4_2	Domain	118	160	2.2e-08	34.5	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057787169.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	118	161	2.5e-14	54.0	Ring finger domain
`XP_057787169.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	119	160	1.4e-06	28.8	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057787169.1`	Pfam	`PF12678`	zf-rbx1	Domain	124	161	5.6e-09	36.8	RING-H2 zinc finger domain
`XP_057787169.1`	Pfam	`PF12861`	zf-ANAPC11	Domain	125	162	6.7e-06	26.8	Anaphase-promoting complex subunit 11 RING-H2 finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931186.1
ATATTAAGTATAGAGAGAGTGTGTATTACCAAAAAAGGAAATAGGACATTTCGTTTGGGACAGCCCAAAAAGAAAAATAAGACATTTGGTTTGGGACGGAGGGAGTATAAGAGTAGACATGGTAGATCTAGAAAATGAGAATCCAGCGGACAGCATAACAGTGTGAAAGAAAACTAGTAAACACGGGAAAGACCAATCCCACGGTTTAAGCATTCGCAAATATGAATTCCAGCCAAGCCTGTCTCACATGTTTGCCTACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131004487
ATGCCCATCTTCACTTTTCTCCTTTTCTTCATTCTCTCCAATCATTCTTTACTCACCGCCGCCACTGGGAATGCCACCACTATTGCCAACTCCACCACCGCTCCACCGCCGCCGCTCAGAACCTCCGCGGCGTTCAAGCCCGGAATAGCGGCCGTGGTGGGGATACTCACCACCACTTTCTCAATCACTTTTTTACTGCTTCTTTACGTGAAGCATTGCAAAGGGAGCAGCTACGGTAATGCTTCGAGAGGCTACCCGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787169.1
MPIFTFLLFFILSNHSLLTAATGNATTIANSTTAPPPPLRTSAAFKPGIAAVVGILTTTFSITFLLLLYVKHCKGSSYGNASRGYPPSRRNSGINRKVIESLPMFRFSSLRGHKDGLECAVCLNKFEAEEVLRLLPKCKHAFHVECVDTWLEAHSTCPLCRYRVDPEDVLLVDTSALATPRASGAAPAPAPAPRVSGRHSSAGERGTALEIIAENPRDDLLRGRVSLDSWNSRRKTGAGSGGKMLDRLSVAENPGRRGKA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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