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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004601`

染色体: Chr01 坐标: 63995427-64002877 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004601`
名称	SmilChr01G004601
描述	putative glucose-6-phosphate 1-epimerase
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	63995427 - 64002877 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131004554`
GeneID	`131004554`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131004554`
原始查询	`LOC131004554`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative glucose-6-phosphate 1-epimerase
产物	putative glucose-6-phosphate 1-epimerase
Arabidopsis	`AT5G57330` (AT5G57330) Galactose mutarotase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835838] identity=78.1; qcov=0.966; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0658000` (24K23.3) - identity=81.1; qcov=0.969; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005975 (carbohydrate metabolic process); GO:0016853 (isomerase activity); GO:0030246 (carbohydrate binding)
KEGG	smil00010 (Glycolysis / Gluconeogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01263 (Aldose_epim)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131004554

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057787245.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057787245.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787245.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787245.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057787245.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:64000717`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B50
`Chr1:64001715`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787245.1

322 aa

161

322

Aldose_epim

PF01263 Aldose_epim 27-301 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787245.1`	Pfam	`PF01263`	Aldose_epim	Family	27	301	7.2e-73	246.3	Aldose 1-epimerase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931262.1
CAGAAGAAAGAAAACAGAAAAGAAAAAGAAAAAGACAAGTGGACTTACTTGCCGTGAATAAGACTGGGCTACCGATAAAGCGGAGCCCCACGCGACCACTACCCTCTCTCAAAAAGCGAAAGTACAAAATCTAAATATAAACACCAAAACTTAATACTTCCATTTGCGGTTACATAAATTTCTTCACTAATGAGGCTTTGCTGCTAAAGGAAAATTGAGAGAATCAATATTCCACTGCACGCACCTTCACTGCCCTTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131004554
ATGTCATCGGCAGCGGCGGCGGCGGCGGCGAACGAGAAGCCTCCGGTGCAAATATGCAAGGGAATCAACGGCCTCGAGAAGGTCGTTCTCCGCGACTTCCGCGGCAGCTCCGTCGAGATATATCTTTATGGTGCTCATGTAACATCGTGGAAGAACGAGCACGGAGAGGAGTTGCTTTTTGTTAGTAGTAAGGCCATCTTCAAACCTCCAAAGGCAATCCGTGGAGGCATCCCTATATGCTTCCCGCAGTTCTCTAACTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787245.1
MSSAAAAAAANEKPPVQICKGINGLEKVVLRDFRGSSVEIYLYGAHVTSWKNEHGEELLFVSSKAIFKPPKAIRGGIPICFPQFSNFGPLEAHGFARNRFWSIDPSPPPFPVNSSNKTYVDLLLKPTEEDMKIWSHSFEFRLRVTLGPAGDLMLTSRIRNTNPDGKPFTFTFAYHTYFSVSDISEVRVEGLETLDYLDNLQNRQRFTEQGDAITFESEVDKIYLSTPTKIAILDHEKKRTFVIRKDGLPDAVVWNPWDKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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