当前解析结果
SmilChr01G001230| 统一新 Gene ID | SmilChr01G001230 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G001230 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G001230 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 24723900 - 24725622 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131004625 |
|---|---|
| GeneID | 131004625 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131004625 |
| 原始查询 | LOC131004625 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT3G05850 (MUG7)MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=23.3; qcov=0.974; evalue=2.07e-19; confidence=weak |
| Rice | Os09g0268600- identity=25; qcov=0.725; evalue=5.11e-20; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131004625 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057787342.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057787342.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057787342.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057787342.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057787342.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:24723987 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C37 |
Chr1:24724111 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr1:24724118 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr1:24724120 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C66,D10 |
Chr1:24724140 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr1:24724144 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B139,B32,C37 |
Chr1:24724343 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B103,C39 |
Chr1:24724350 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B3,B46 |
Chr1:24724390 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B46 |
Chr1:24724397 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C39,C69 |
Chr1:24724409 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C69 |
Chr1:24724422 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B103 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。