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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004583`

染色体: Chr01 坐标: 63872214-63875822 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004583`
名称	SmilChr01G004583
描述	protein LSD1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	63872214 - 63875822 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131004698`
GeneID	`131004698`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131004698`
原始查询	`LOC131004698`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein LSD1-like
产物	protein LSD1-like
Arabidopsis	`AT4G20380` (LSD1) LSD1 zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827786] identity=64.7; qcov=1.07; evalue=9.3e-72; confidence=high
Rice	`Os03g0639600` (OsLSD2) - identity=65.2; qcov=1.07; evalue=6.96e-73; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06943 (zf-LSD1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131004698

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057787406.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057787406.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057787406.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787406.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057787406.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:63874214`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787406.1

175 aa

175

zf-LSD1

PF06943 zf-LSD1 7-31 aa PF06943 zf-LSD1 46-70 aa PF06943 zf-LSD1 83-107 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787406.1`	Pfam	`PF06943`	zf-LSD1	Domain	7	31	1.2e-39	134.6	LSD1 zinc finger
`XP_057787406.1`	Pfam	`PF06943`	zf-LSD1	Domain	46	70	1.2e-39	134.6	LSD1 zinc finger
`XP_057787406.1`	Pfam	`PF06943`	zf-LSD1	Domain	83	107	1.2e-39	134.6	LSD1 zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931423.1
GGCCTCAACATTTATATTTTTATTTACAGAATATATATACGTATGAAAAAGATTTTCTTGTACTCCTAAAAATATTTTACTAATATTAATATTAATAAATCGGGCAATTAATGAAAGGGACCATCTGACCACCATTGAGAAAAAGTTAAAAGTAAAAATGTCAAGTCACTCGCCGTCTCCTTCATTTCCTTGAATTAAACTTCCGATTGGGATTCCGATTCCCTTCGGATTATCCGAATTTCTACCATAATTGCCCTAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131004698
ATGCAGAGCCAGGTAGTGTGCAGCGGGTGCAGGAGTCTTCTAATGTACCCGAGTGGGGCCACCAATGTGTGTTGCGCCTTGTGTAATTCTGTCACCACCATCCCCCCTTCAGGAATGGAAATGGCCCAACTGATATGTGGAGGCTGCCGTACATTATTGATGTATACTCGGGGTGCTACCAGTGTGAGATGCTCCTGTTGTCACACAGTGAACCTAGCACCAGCACCTAATATCGCTCACATCAACTGTGGAAACTGTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787406.1
MQSQVVCSGCRSLLMYPSGATNVCCALCNSVTTIPPSGMEMAQLICGGCRTLLMYTRGATSVRCSCCHTVNLAPAPNIAHINCGNCHTTLMYPYGAPSVKCAVCQYITNVNMGNVRVPLPMHRPIGPASPAPMPSGSSPLPNPQSQTVVVENPMSVDKSGKLVSNVVVGITTDKK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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