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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004620`

染色体: Chr01 坐标: 64227557-64235522 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004620`
名称	SmilChr01G004620
描述	protein YIP4a-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	64227557 - 64235522 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131004811`
GeneID	`131004811`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131004811`
原始查询	`LOC131004811`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein YIP4a-like
产物	protein YIP4a-like
Arabidopsis	`AT2G18840` (AT2G18840) Integral membrane Yip1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816399] identity=79.7; qcov=1.02; evalue=1.14e-135; confidence=high
Rice	`Os01g0867700` - identity=79; qcov=1; evalue=9.85e-127; confidence=high
GO	GO:0005802 (trans-Golgi network); GO:0006888 (endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF04893 (Yip1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131004811

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057787553.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.80000	`XP_057787553.1`
3	Cis-golgi network	Cis-golgi network	0.20000	`XP_057787553.1`
4	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057787553.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787553.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:64233792`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B107
`Chr1:64233792`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B107
`Chr1:64233800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr1:64233961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr1:64233979`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,B64,B87,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787553.1

280 aa

140

280

Yip1

PF04893 Yip1 142-274 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787553.1`	Pfam	`PF04893`	Yip1	Domain	142	274	2.2e-15	57.7	Yip1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931570.1
TATAAGTGCGAAAAGGTACTAGGTTGTTTGATAACACACACTATCTTCACGTCATAATGACAAAAGGTCCAAAATATCCTTAGGAACATTACTGAATGACTAAGGTGTCCTTCACATTTTTTTTAGTCAAAACATGAAACATTTTCAAACAAAAAATTGTTCAACCATATGCCCGCTGACAATGTTCTCAACAAAGCTAAAACACAGCTAAACAATGAATCTATGGAGCAACTCAGCAACGACAACAATTCTTCCAGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131004811
ATGTCTTACAGTGACACGGTTCCGCTGCATCCGAGCTCCCAATCGGACATCGACGAGATCGAGAACCTCATCCACTCCAACCCCTTACCCGTCCTCCCCGCTCGCCCCCCGTCTCCTCCACGCGCCTCCATCCCCGTCTCCTCCGCTCCACCTCCTCCCCCTACCTTCATCCCCTCCAATCTCCCCCCTCCGACCGTCCCCAAGCCAACTCCCGTCCCTTCCACCGTTCCTAAACCCCCTCTTGCCCCGCCGATTGGATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787553.1
MSYSDTVPLHPSSQSDIDEIENLIHSNPLPVLPARPPSPPRASIPVSSAPPPPPTFIPSNLPPPTVPKPTPVPSTVPKPPLAPPIGSASSSAGIASSGFGSPPNTLTEPVWDTIKRDLSRIVSNLKLVVFPNPYREDPGKALRDWDLWGPFFFIVFLGLTLSWSASVKKSEVFAVAFALLAAGAIILTLNVLLLGGHIIFFQSLSLLGYCLFPLDVGALICMLKDNVIIKVVVVVVTLAWSSWAAYPFMSSAVGPRRKAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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