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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004646`

染色体: Chr01 坐标: 64517654-64519189 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004646`
名称	SmilChr01G004646
描述	PTI1-like tyrosine-protein kinase At3g15890
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	64517654 - 64519189 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131004997`
GeneID	`131004997`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131004997`
原始查询	`LOC131004997`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PTI1-like tyrosine-protein kinase At3g15890
产物	PTI1-like tyrosine-protein kinase At3g15890
Arabidopsis	`AT1G52540` (AT1G52540) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841685] identity=55.8; qcov=0.778; evalue=2.68e-114; confidence=high
Rice	`Os09g0531701` - identity=61; qcov=0.883; evalue=2.58e-144; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131004997

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057787756.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057787756.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787756.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787756.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057787756.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:64518071`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B105,B75,B81
`Chr1:64518071`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B75,B81
`Chr1:64518141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr1:64518152`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:64518207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr1:64518234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B62,B63,C80
`Chr1:64518427`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B130
`Chr1:64518427`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B130

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787756.1

369 aa

184

369

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 45-311 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 47-311 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787756.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	45	311	1.2e-40	140.4	Protein kinase domain
`XP_057787756.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	47	311	1.4e-42	146.6	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931773.1
AAGCTGACTATGTCAATAAAAGAGAGGCTGATTCGAAACTAGAAATCTATATAATTAGTTAATCTAGTAGGAGCAGCCGGCTTAGGACGGCAGTGCCACAATTGACAAGGACACACATTTTCCATCTAAAATTCTTTAAAGAACATCTTCATCGTTGGATTCGCCAAACAAAAAATTCGGAAACTCAAGTCTGAGAAGCCATGGGATCATCCGTCAGTTGCTGCGGCCATGATAAAGTTGAAGAAGGGTTGACGTTGGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131004997
ATGGGATCATCCGTCAGTTGCTGCGGCCATGATAAAGTTGAAGAAGGGTTGACGTTGGGCGGAGGCGAGAACAGCAATCAATGGAGAATTTTCACGTACAAGGAGCTGCATGCGGCGACCAACGGCTTCAGCGAGGACTACAAGCTGGGCGAAGGAGGGTTCGGGAGTGTTTATTGGGGCAGGACATCGGATGGGCTTCAGATTGCAGTGAAGAAGTTGAAGTCGATGAATTCCAAGGCGGAGATGGAGTTCGCGGTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787756.1
MGSSVSCCGHDKVEEGLTLGGGENSNQWRIFTYKELHAATNGFSEDYKLGEGGFGSVYWGRTSDGLQIAVKKLKSMNSKAEMEFAVEVEVLGRVRHKNLLGLRGYCAGNEQRLIVYDYMPNLSLLSHLHGQFAGEVELDWNKRMKVAMGSAQGILYLHHEVTPHIIHRDIKASNVLLDSNFDPLVADFGFAKLIPEGVSHMTTRVKGTLGYLAPEYAMWGKVSESCDVYSFGILLLEIVTGRKPIEKLPGGIKRTITEWA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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