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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004665`

染色体: Chr01 坐标: 64750876-64754238 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004665`
名称	SmilChr01G004665
描述	very-long-chain aldehyde decarbonylase CER3-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	64750876 - 64754238 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005015`
GeneID	`131005015`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005015`
原始查询	`LOC131005015`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	very-long-chain aldehyde decarbonylase CER3-like
产物	very-long-chain aldehyde decarbonylase CER3-like
Arabidopsis	`AT5G57800` (CER3) Fatty acid hydroxylase superfamily [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835889] identity=66.3; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0653000` (OsGL1-3) - identity=65; qcov=0.987; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005506 (iron ion binding); GO:0008610 (lipid biosynthetic process); GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF04116 (FA_hydroxylase); PF12076 (CER1-like_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005015

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057787782.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057787782.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057787782.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787782.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057787782.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:64751792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr1:64751882`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:64753003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr1:64753305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C59
`Chr1:64753621`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787782.1

631 aa

316

631

FA_hydroxylase

CER1-like_C

PF04116 FA_hydroxylase 129-269 aa PF12076 CER1-like_C 451-620 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787782.1`	Pfam	`PF04116`	FA_hydroxylase	Domain	129	269	1.9e-19	71.1	Fatty acid hydroxylase
`XP_057787782.1`	Pfam	`PF12076`	CER1-like_C	Domain	451	620	8.9e-65	218.2	CER1-like, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931799.1
AATTAATACAGAGCCTCAAATGCAGCAAATTAGGCATATTGCTGTAGCAATAAATGTGTCATTCAACCTATTCGCAAACACCACTCCAAAGAAACAGAAGCAAAACTCTAGTATTTGAAGCATTATATATATCCCATCCTAAAATCTGCATTCGCTAGTAACAGAAAACAAACTTTCATTCTCCAACCGCTAATCTCTCATTTGGAAATCGCATTATTTTAGGCGCTCAAAGGTTTTAGGAATCTCGAGACCATGGTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005015
ATGGTTTCACCATTGTCTGCTTGGCCATGGGAATTCTTGGGTAACTACAAGCTTGGTGTTTATGGGGTTTTCCTGGGGAAAGCAATATATTCAAGATTTCAAGAAGAAGGCATGAAACAGACTAATTGGTTTCTTCACATCTTCATCATATGTATGCTGAGACTCTTTGTGCACCAGCTATGGAGTTCTTACAGCAGCATGCTCTTTCTCACTCGCAACCGACAGATTAACAAGCAAGGAATTGATTTCAAACAGATTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787782.1
MVSPLSAWPWEFLGNYKLGVYGVFLGKAIYSRFQEEGMKQTNWFLHIFIICMLRLFVHQLWSSYSSMLFLTRNRQINKQGIDFKQIDKEWNWDNFIILQGIIGALVLYMFPTFERLCIWNKNGLSAALVLHVSISEPLFYTIHRCFHGDYLFSRYHSFHHSSPVPQPLTAGNATFLEHLLLTVVVAVPIIGTFAIGHGSISLIYAYLLLFDCLRCLGHSNVEFIPHQIFDAAPFLKYLLYTPTYHYLHHVEKDSNYCLFM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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