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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004708`

染色体: Chr01 坐标: 65183708-65185383 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004708`
名称	SmilChr01G004708
描述	probable WRKY transcription factor 40
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	65183708 - 65185383 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005056`
GeneID	`131005056`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005056`
原始查询	`LOC131005056`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable WRKY transcription factor 40
产物	probable WRKY transcription factor 40
Arabidopsis	`AT1G80840` (WRKY40) WRKY DNA-binding protein 40 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844423] identity=47.7; qcov=1.07; evalue=1.94e-87; confidence=high
Rice	`Os02g0181300` (WRKY71) - identity=38.3; qcov=0.997; evalue=3.43e-53; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03106 (WRKY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005056

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057787833.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057787833.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057787833.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057787833.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057787833.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:65184357`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	C26,C40,C8
`Chr1:65184357`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	C26,C40,C8
`Chr1:65184394`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B53,C26,C69,C78
`Chr1:65184394`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B53,C26,C69,C78
`Chr1:65184770`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr1:65184771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,C48,C83
`Chr1:65184878`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A16,B18,B70,C58,C64,C66,C78,C85
`Chr1:65185076`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B139,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057787833.1

301 aa

150

301

WRKY

PF03106 WRKY 149-206 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057787833.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	149	206	9.4e-24	84.1	WRKY DNA -binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057931850.1
ATTTTATCTCACCCCCATCATCTTCCTCCTTACTTTCCTCCAACTTGTCTCTCTCTCCTCTCTCCTCTCTCGCTATATAAACCCCCACACGCCCTTTCTTTCATTGGCAACTGCTGCAGAAAACATCAAGACAACAACAACAATTCAATTAATTGAAATCTTTTTTATGGAGTTCACAAGCCTGCTGAACAATTCATTGGATCTGAATGCCAAGCCTCTGAGATTTCTGGACGAGTCGCCTCCACTGAAACATCAAGTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005056
ATGGAGTTCACAAGCCTGCTGAACAATTCATTGGATCTGAATGCCAAGCCTCTGAGATTTCTGGACGAGTCGCCTCCACTGAAACATCAAGTGCTGGAGAGCAGCTTCATTGGGTTGGGAACAAGTGTTGTGAATGTGAAGGAAGAAAAAGGTGCTCTGATTGAAGAGCTGAATAGGGTGAGTGCGGAGAACAAGAAACTGACTGAATTGCTGACAGTGATGTGTGAGAATTACACTGAGCTGAGAAACCAGTTGGTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057787833.1
MEFTSLLNNSLDLNAKPLRFLDESPPLKHQVLESSFIGLGTSVVNVKEEKGALIEELNRVSAENKKLTELLTVMCENYTELRNQLVEQTGKNVNVVENSNAASRKRKAESSNIDALNPESSSSDEESSKKPREEHIKAKISRLCLQIVKDGYQWRKYGQKVTRDNPCPRAYFKCSFAPTCPVKKKVQRSVEDQSILVASYEGEHNHAPPSKVESNSSGSNKNSNLGSTSVSSTAAPTVTLDLTKPKQESTNATPKLDAPE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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