当前解析结果
SmilChr01G001264| 统一新 Gene ID | SmilChr01G001264 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G001264 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G001264 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 25338009 - 25339089 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131005069 |
|---|---|
| GeneID | 131005069 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131005069 |
| 原始查询 | LOC131005069 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131005069 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057787851.1 |
| 2 | Nuclear body | 核内小体 | 0.80000 | XP_057787851.1 |
| 3 | PML body | PML body | 0.80000 | XP_057787851.1 |
| 4 | Nucleoplasm | 核质 | 0.80000 | XP_057787851.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057787851.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:25338191 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B30,C13,C76 |
Chr1:25338193 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C13,C76 |
Chr1:25338197 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 39 | A18,A23,A25,A3,A7,B101,B108,B109,B115,B13,B135,B137,B23,B25,B29,B34,B37,B40,B47,B5,B54,B55,B58,B62,B75,B76,B8,B80,B94,C1,C31,C38,C42,C55,C60,C67,C75,C87,D8 |
Chr1:25338208 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr1:25338222 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B11,B114,B88,C3,D3 |
Chr1:25338224 |
C |
CGG |
2bp_insertion | frameshift_variant | 6 | A19,B30,B77,C52,C78,C83 |
Chr1:25338225 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A1,B132,B2 |
Chr1:25338247 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A1,B2 |
Chr1:25338250 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A11,C29 |
Chr1:25338253 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B107,B98 |
Chr1:25338260 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 4 | B103,B111,B30,C53 |
Chr1:25338260 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 4 | B103,B111,B30,C53 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。